木耳emg1基因克隆与生物信息学分析 |
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引用本文: | 方明,姚方杰,王晓娥,陈影. 木耳emg1基因克隆与生物信息学分析[J]. 吉林农业大学学报, 2013, 35(4) |
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作者姓名: | 方明 姚方杰 王晓娥 陈影 |
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作者单位: | 吉林农业大学园艺学院,长春130118;吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心,长春130118 |
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基金项目: | 现代农业产业技术体系专项 |
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摘 要: | 以毛木耳和皱木耳的cDNA序列为模板设计简并引物并进行扩增,获得1条长度为1075 bp的序列Aa-2;与JGI数据库中皱木耳基因组Blastn比对E值为0;与编码emg1的氨基酸序列Blastx同源性比对的E值高达1.82e-112.与木耳全基因组序列中注释为emg1的核酸序列有775 bp的序列完全一致.经GenBank数据库Blastn同源比对,与玉米丝黑穗菌emg1蛋白cDNA的部分序列相似性达91%.经GenBank中Conserved domains搜索,Aa-2序列与emg1蛋白超家族序列同源比对的E值达2.66e-43,初步判定Aa-2的部分序列为emg1蛋白的编码序列.
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关 键 词: | 木耳 emg1 基因克隆 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of emg1 Gene of Auricularia auricular-judae |
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Abstract: | |
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Keywords: | Auricularia auricula-judae emg 1 gene cloning |
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