新城疫病毒感染鸡胚组织miRNAs表达谱的测序及分析 |
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作者姓名: | 贾燕青 仇薪鑫 王相伟 谢晓刚 白军 王兴龙 杨增岐 |
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作者单位: | 1. 杨凌职业技术学院动物工程分院/动物疫病防控陕西省高校工程研究中心;2. 西北农林科技大学动物医学院 |
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摘 要: | 为了阐明新城疫病毒(NDV)感染鸡胚后miRNAs表达谱的变化及NDV感染与宿主基因之间的相互作用,帮助寻找NDV防控的新靶点和方法。通过small RNA测序技术获得NDV强毒株(F48E9)和弱毒株(La Sota)感染的鸡胚内脏组织miRNAs表达谱。对差异表达的miRNAs进行分析发现,F48E9感染引起了33个miRNAs上调,31个miRNAs下调;La Sota感染引起36个miRNAs上调,25个miRNAs下调;La Sota与F48E9感染组比较,有27个miRNAs上调,22个miRNAs下调。选取10个差异表达miRNAs进行RT-qPCR验证,gga-miR-34a-5p、gga-miR-375、gga-miR-122-3p、gga-miR-187-3p、gga-miR-124a-3p、gga-miR-203a、gga-miR-205a、gga-miR-183、gga-miR-9-3p和gga-miR-451表达量与small RNA测序结果相似。对差异表达miRNAs进行靶基因预测和生物信息学富集分析发现,在NDV感染鸡胚时,差异表达的miRNAs主要参与调...
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关 键 词: | 新城疫病毒 small RNA测序 miRNA 实时荧光定量PCR |
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