| 南方和北方根结线虫分泌蛋白组预测与比较分析 |
| |
| 引用本文： | 王运生,李午佼.南方和北方根结线虫分泌蛋白组预测与比较分析[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2011,37(4):376-380. |
| |
| 作者姓名： | 王运生 李午佼 |
| |
| 作者单位： | 湖南农业大学生物安全科学技术学院,湖南长沙,410128 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，湖南农业大学稳定人才基金项目 |
| |
| 摘 要： | 通过SignalP 3.0、TargetP 1.1、KohGPI、TMHMM 2.0等系列软件对南方和北方根结线虫分泌蛋白组进行预测.结果表明,南方和北方根结线虫预测分泌蛋白数为2622和1696个,分别占总基因数的13.65%和12.95%.经BlastP(E＜1e-10)分析,分别有754个和466个能在KOG(e...
|
| 关 键 词： | 根结线虫 分泌蛋白 模体 |
| 收稿时间： | 2010/12/28 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2011/4/21 0:00:00 |
Prediction and comparative analysis of secretory proteins of Meloidogyne incognita and Meloidogyne hapla |
| |
| WANG Yun-sheng and LI Wu-jiao.Prediction and comparative analysis of secretory proteins of Meloidogyne incognita and Meloidogyne hapla[J].Journal of Hunan Agricultural University,2011,37(4):376-380. |
| |
| Authors: | WANG Yun-sheng and LI Wu-jiao |
| |
| Institution: | LI Wu-jiao,YAN Jin,WANG Yun-sheng(College of Bio-Safety Science and Technology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China) |
| |
| Abstract: | Secretory proteins play an important role in the process of molecular interaction between pathogen and host plants.In this paper,we employed SignalP 3.0,TargetP 1.1,KohGPI and TMHMM 2.0 to predict the secretory proteins of root-knot nematode and finally we got 2 622 and 1 696 secretory proteins for Meloidogyne incognita and Meloidogyne hapla respectively,correspondingly accounted for 13.65% and 12.95% of the total proteins.754 and 466 secretory proteins from Meloidogyne incognita and Meloidogyne hapla respe... |
| |
| Keywords: | root-knot nematode secretory protein motif |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《湖南农业大学学报(自然科学版)》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《湖南农业大学学报(自然科学版)》下载免费的PDF全文 |
