| 牡丹TCP家族基因的鉴定与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张延召,罗新,李会云,段旭佳,张妍.牡丹TCP家族基因的鉴定与生物信息学分析[J].分子植物育种,2022(1). |
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| 作者姓名： | 张延召 罗新 李会云 段旭佳 张妍 |
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| 作者单位： | 洛阳师范学院生命科学学院 |
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| 基金项目： | 河南省科技厅科技攻关项目(192102110035,202102110046);国家自然科学基金项目(31700604)共同资助。 |
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| 摘 要： | TCP(Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor)家族基因是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育的过程中具有重要的调控作用。本研究从牡丹转录组数据中鉴定出18个TCP基因,分子量在18978.32~51789.56 Da之间,等电点在5.81~9.45之间,TCP家族成员亚细胞定位预测均在细胞核中。牡丹TCP结构域中保守氨基酸的分类与拟南芥相似,系统发育分析结果表明,牡丹TCP蛋白分为两大类,ClassⅠ包含10个TCP成员,ClassⅡ包含8个TCP成员。MEME分析结果显示,在牡丹TCP蛋白中发现了15个保守结构域,其中motif 1为TCP结构域,在所有TCP成员中都存在。同时,对牡丹TCP基因在芽、叶、花瓣、花斑、雄蕊、雌蕊和种子7个组织中的转录水平进行了分析。本研究对牡丹TCP家族基因进行了系统的分析,为进一步开展牡丹功能基因研究及分子育种提供了科学依据。
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| 关 键 词： | 牡丹 TCP家族基因 TCP结构域 |
Identification and Bioinformatics Analysis of TCP Family Genes in Tree Peony |
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| Zhang Yan.Identification and Bioinformatics Analysis of TCP Family Genes in Tree Peony[J].Molecular Plant Breeding,2022(1). |
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| Authors: | Zhang Yan |
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| Institution: | (College of Life Science,Luoyang Normal University,Luoyang,471934) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Tree peony TCP family gene TCP domain |
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