| 榴莲PEPC基因家族全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 彭文丽,杨成坤,崔志富,赵成志,王红. 榴莲PEPC基因家族全基因组鉴定及表达分析[J]. 分子植物育种, 2022, 0(1) |
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| 作者姓名： | 彭文丽 杨成坤 崔志富 赵成志 王红 |
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| 作者单位： | 海南省农垦科学院;温州市农业科学研究院;海南大学园艺学院 |
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| 基金项目： | 海南省重点研发计划项目(ZDYF2019025);海南省研究生创新课题(No.Hys2019-90)共同资助。 |
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| 摘 要： | 本研究从榴莲全基因组中鉴定榴莲PEPC基因,并分析了它们在‘猫山王’榴莲不同组织(根,茎,叶和果肉)与3个不同品种(‘猫山王’,‘金枕头’和‘普玛尼’)果肉中的表达情况。结果共获得6个榴莲Dz PEPC家族成员,其蛋白理化特征较为相似,且所有榴莲PEPC蛋白亚细胞定位预测均可能存在于细胞质中。染色体定位显示榴莲PEPC位于5条不同的染色体。联合榴莲、水稻、菠萝、拟南芥的PEPC蛋白共同进行系统进化分析,结果显示共可分为2个亚组,Dz PEPC1、Dz PEPC3、Dz PEPC4和Dz PEPC5为PTPC亚族(植物型),Dz PEPC2和Dz PEPC6为BTPC亚族(细菌型),且发现榴莲PTBC和BTPC分离时间早于单子叶植物和双子叶植物的分离时间,两者基因结构和蛋白序列差异大,但仍具有一定的保守性。顺式作用元件分析显示,DzPEPC含有数量较多的光响应元件和激素响应元件。转录组表达分析发现,DzPEPCs在不同榴莲组织中的表达具有偏好性,可能参与榴莲的多个生物学过程(包含光合和非光合过程),并初步推测DzPEPC4与榴莲果肉发育过程相关。本研究可为进一步探究DzPEPC家族在榴莲中的生物学功能提供参考。
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| 关 键 词： | 榴莲 PEPC基因家族 表达分析 |
Genome-wide Identification and Expression Analysis of PEPC Gene Family in Durian(Durio zibethinus Murr.) |
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| Peng Wenli,Yang Chengkun,Cui Zhifu,Zhao Chengzhi,Wang Hong. Genome-wide Identification and Expression Analysis of PEPC Gene Family in Durian(Durio zibethinus Murr.)[J]. Molecular Plant Breeding, 2022, 0(1) |
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| Authors: | Peng Wenli Yang Chengkun Cui Zhifu Zhao Chengzhi Wang Hong |
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| Affiliation: | (Hainan Agricultural Reclamation Academy of Sciences,Haikou,570311;Wenzhou Academy of Agricultural Sciences,Wenzhou,325006;Engineering Research Center of Selecting and Breeding New Tropical Crops Varieties,Ministry of Education,Horticulture College,Hainan University,Haikou,570228) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Durian PEPC gene family Expression analysis |
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