首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

杜洛克猪全基因组连锁不平衡分析
引用本文:刁淑琪,罗元宇,蔡 迪,陈桂华,陈赞谋,张 豪,李加琪,张 哲. 杜洛克猪全基因组连锁不平衡分析[J]. 广东农业科学, 2016, 43(11): 116-121. DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2016.11.018
作者姓名:刁淑琪  罗元宇  蔡 迪  陈桂华  陈赞谋  张 豪  李加琪  张 哲
作者单位:华南农业大学动物科学学院,广东广州,510642
基金项目:广东省自然科学基金(2014A03031345),国家现代农业产业技术体系项目(CARS-36),华南农业大学大学生创新训练项目(201410564155)
摘    要:利用猪Illumina Porcine SNP60K芯片对福建某核心种猪场杜洛克猪216个个体进行基因型检测,基于该高密度SNP芯片数据,运用Haploview软件计算全基因组连锁不平衡并构建杜洛克猪连锁不平衡图谱。结果表明,该杜洛克猪群体不同染色体上相邻标记间r2存在波动,波动范围为0.46~0.59,相邻标记间的平均连锁不平衡程度r2为0.52,SSC10的r2最低(平均为0.46),SSC6的r2最高(平均为0.59),连锁不平衡水平随着标记间距的增加而衰减、变异程度随之减小。该研究结果可为杜洛克猪遗传分析及全基因组选择研究提供参考。

关 键 词:  连锁不平衡  杜洛克  SNP

Genome-wide linkage disequilibrium analysis in Duroc pigherd
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
点击此处可从《广东农业科学》浏览原始摘要信息
点击此处可从《广东农业科学》下载全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号