| 杜洛克猪全基因组连锁不平衡分析 |
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| 引用本文： | 刁淑琪,罗元宇,蔡 迪,陈桂华,陈赞谋,张 豪,李加琪,张 哲. 杜洛克猪全基因组连锁不平衡分析[J]. 广东农业科学, 2016, 43(11): 116-121. DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2016.11.018 |
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| 作者姓名： | 刁淑琪 罗元宇 蔡 迪 陈桂华 陈赞谋 张 豪 李加琪 张 哲 |
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| 作者单位： | 华南农业大学动物科学学院,广东广州,510642 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金(2014A03031345)，国家现代农业产业技术体系项目(CARS-36)，华南农业大学大学生创新训练项目(201410564155) |
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| 摘 要： | 利用猪Illumina Porcine SNP60K芯片对福建某核心种猪场杜洛克猪216个个体进行基因型检测,基于该高密度SNP芯片数据,运用Haploview软件计算全基因组连锁不平衡并构建杜洛克猪连锁不平衡图谱。结果表明,该杜洛克猪群体不同染色体上相邻标记间r2存在波动,波动范围为0.46~0.59,相邻标记间的平均连锁不平衡程度r2为0.52,SSC10的r2最低(平均为0.46),SSC6的r2最高(平均为0.59),连锁不平衡水平随着标记间距的增加而衰减、变异程度随之减小。该研究结果可为杜洛克猪遗传分析及全基因组选择研究提供参考。
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| 关 键 词： | 猪 连锁不平衡 杜洛克 SNP |
Genome-wide linkage disequilibrium analysis in Duroc pigherd |
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