芋头过氧化物酶基因克隆 |
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引用本文: | 莫俊杰,梁钾贤,胡汉桥,黄 红,陈 妤. 芋头过氧化物酶基因克隆[J]. 广东农业科学, 2016, 43(9): 37-43. DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2016.09.006 |
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作者姓名: | 莫俊杰 梁钾贤 胡汉桥 黄 红 陈 妤 |
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作者单位: | 广东海洋大学农学院,广东湛江,524088 |
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基金项目: | 国家公益性行业(农业)科研专项经费子课题分项目(200903017-08) |
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摘 要: | 根据芋头的密码子使用频率,用i CODEHOP设计简并引物扩增芋头过氧化物酶基因序列,待芋头过氧化物酶基因非侧翼序列扩增成功后,依据其序列合成hiTAIL-PCR引物扩增芋头过氧化物酶基因的两侧序列。结果从芋头基因组DNA中克隆出1 165 bp序列,经同源性分析为过氧化物酶基因的部分序列;再利用hiTAIL-PCR技术可以扩增出芋头过氧化物酶基因的两侧序列,扩增序列为689 bp,测序结果能与1 165 bp序列拼接到一起,长1 854 bp。与已知的过氧化物酶进行序列比对,发现两侧还有氨基酸的编码序列,因此进行第2次hiTAIL-PCR,扩增出165 bp芋头过氧化物酶基因的侧翼序列,拼接后得到2 019bp。用Softberry上的基因预测软件分析后,发现包含过氧化物酶4个外显子,同源性分析表明,此过氧化物酶基因为含血红素的第三类过氧化物酶。
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关 键 词: | 芋头 过氧化物酶基因 hiTAIL-PCR 克隆 |
Cloning of peroxidase gene in taro |
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Abstract: | |
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