沼气池微生物生态群落PCR-DGGE分析方法研究 |
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引用本文: | 胡宇容,叶小梅,常志州,杜静,陈双林.沼气池微生物生态群落PCR-DGGE分析方法研究[J].江苏农业科学,2012(3):39-42. |
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作者姓名: | 胡宇容 叶小梅 常志州 杜静 陈双林 |
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作者单位: | 南京师范大学生命科学学院;江苏省农业科学院农业资源与环境研究所 |
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基金项目: | 农业部公益性行业计划(编号:200903011-01);江苏省农业废弃物资源化工程技术研究中心项目(编号:BM2008009) |
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摘 要: | 研究了适合于PCR-DGGE分析的沼气池污泥样品微生物基因组DNA快速提取方法,探讨了PCR反应条件、电泳时间与上样量对DGGE指纹图谱多样性的影响。试验结果表明,采用本研究所建立的SDS和Guanidine thio-cyanate-N-LS方法提取沼渣微生物总DNA,利用细菌特异性16S rDNA通用引物,经复原条件PCR(循环25次)扩增,所得PCR产物在85V电压下,上样量600ng,电泳时间为16 h时DGGE分离效果最佳,获得清晰的16S rDNA V3区片段的图谱。
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关 键 词: | 沼气池 微生物群落 DCR-DGGE分析 |
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