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五指山猪线粒体基因组全序列测定与分析
引用本文:于 萍,曹 婷,赵春萍,刘雅芳,施力光,张立岭,侯冠彧.五指山猪线粒体基因组全序列测定与分析[J].西北农业学报,2015,24(7):16-22.
作者姓名:于 萍  曹 婷  赵春萍  刘雅芳  施力光  张立岭  侯冠彧
作者单位:(1.中国热带农业科学院 热带作物品种资源研究所,海南儋州 571737;2.海南大学 农学院,海口 570228)
基金项目:中央级公益性科研院所基本业务费(1630032013020)。
摘    要:采用PCR及TA克隆测序技术,获得五指山猪线粒体基因组全序列(KJ909516),并对其特征进行具体分析。结果表明,五指山猪线粒体基因组序列全长16 689bp,碱基组成为A(34.7%)、C(26.2%)、G(13.3%)、T(25.8%),包含13个蛋白编码区,2个rRNA,22个tRNA和1个非编码控制区(D-Loop区)。13个蛋白质编码基因中,ND2、ND3和ND5起始密码子为ATA,ND4L起始密码子为GTG,其余均为ATG。蛋白编码基因ND1和ND2终止密码子为TAG,Cyt b终止密码为AGA,COXⅡ、COXⅢ、ND3和ND4的终止信号为不完全密码子T,其余均为TAA。22个tRNA中除tRNASer(AGY)缺少DHU臂外,其余tRNA均可形成典型三叶草结构。线粒体控制区全长1 254bp,含有22个长度为10bp的串联重复序列ACGTGCGTAC。5种中国小型猪蛋白质编码基因的比对结果说明,五指山猪在ND2和ND5基因上与其他4个猪种存在明显差异,可为能量代谢差异研究提供分子学依据。

关 键 词:五指山猪  线粒体基因组  蛋白质编码区  控制区

Complete Mitochondrial Genome Sequence and Analysis of Wuzhishan Pig
YU Ping,CAO Ting,ZHAO Chunping,LIU Yafang,SHI Liguang,ZHANG Liling and HOU Guanyu.Complete Mitochondrial Genome Sequence and Analysis of Wuzhishan Pig[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2015,24(7):16-22.
Authors:YU Ping  CAO Ting  ZHAO Chunping  LIU Yafang  SHI Liguang  ZHANG Liling and HOU Guanyu
Abstract:
Keywords:Wuzhishan pig  Mitochondrial genome  Protein-coding genes  Control region
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