| 大麻GRAS转录因子家族的全基因组鉴定及镉胁迫下表达分析 |
| |
| 引用本文： | 尹明,杨大为,唐慧娟,潘根,李德芳,赵立宁,黄思齐. 大麻GRAS转录因子家族的全基因组鉴定及镉胁迫下表达分析[J]. 作物学报, 2021, 0(6): 1054-1069 |
| |
| 作者姓名： | 尹明 杨大为 唐慧娟 潘根 李德芳 赵立宁 黄思齐 |
| |
| 作者单位： | 中国农业科学院麻类研究所/农业农村部麻类生物学与加工重点实验室 |
| |
| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-16-E02)资助。 |
| |
| 摘 要： | GRAS转录因子在植物生长发育及抗逆境胁迫中具有重要作用。本文对大麻GRAS转录因子家族进行了全基因组鉴定,对其理化性质、系统进化发育、基因结构、基因间的共线性关系进行了分析,并利用云麻1号及内蒙古小粒大麻的转录组数据分析其在镉胁迫下的表达量变化。结果表明,大麻基因组中鉴定出54个GRAS基因, 96.30%的基因编码酸性蛋白,长度为415～757aa,分子质量为46,405.05～85,748.52kD,等电点为4.77～8.54,划分为9个亚家族,其中PAT1、LS、SHR、HAM保守性较高, PAT1、LISCL、CsGRASA出现大量基因串联重复, CSGRAS12基因在5种植物的共线性分析中均存在。将2个大麻品种进行镉胁迫处理发现,云麻1号株高下降10.48%,鲜重下降6.33%;内蒙古小粒大麻株高下降66.07%,鲜重下降42.67%,表明云麻1号较内蒙古小粒大麻更耐镉胁迫。云麻1号的54个GRAS基因中, 42个(77.78%)基因表达上调1.05～18.10, 11个(20.37%)基因表达下调0.13～0.91;内蒙古小粒大麻的54个GRAS基因中, 27个(50.0...
|
| 关 键 词： | 大麻 GRAS转录因子 系统发育分析 基因结构分析 表达分析 |
Genome-wide identification of GRAS transcription factor and expression analysis in response to cadmium stresses in hemp(Cannabis sativa L.) |
| |
| YIN Ming,YANG Da-Wei,TANG Hui-Juan,PAN Gen,LI De-Fang,ZHAO Li-Ning,HUANG Si-Qi. Genome-wide identification of GRAS transcription factor and expression analysis in response to cadmium stresses in hemp(Cannabis sativa L.)[J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 0(6): 1054-1069 |
| |
| Authors: | YIN Ming YANG Da-Wei TANG Hui-Juan PAN Gen LI De-Fang ZHAO Li-Ning HUANG Si-Qi |
| |
| Affiliation: | (Institute of Bast Fiber Crops,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Biological and Processing for Bast Fiber Crops,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Changsha 410205,Hunan,China) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
|
