影响猪精子耐冻性的候选基因分析 |
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引用本文: | 王文君,王小康,徐国强,周翔,刘榜. 影响猪精子耐冻性的候选基因分析[J]. 华中农业大学学报, 2021, 40(3): 203-211 |
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作者姓名: | 王文君 王小康 徐国强 周翔 刘榜 |
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作者单位: | 华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,武汉 430070;华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,武汉 430070;生猪健康养殖省部共建协同创新中心/湖北省地方猪品种改良工程技术研究中心,武汉 430070 |
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基金项目: | 国家自然科学基金重点项目(31930104) |
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摘 要: | 在对通城猪精液冷冻保存的过程中,发现精液冻存质量存在个体差异。根据多次精液冻存后的精子活力检测结果,结合系谱关系筛选出精子耐冻与不耐冻个体各3头,并采用"中芯一号"SNP芯片进行群体遗传分化指数(FST)分析,应用生物信息学方法挖掘影响猪精子耐冻性差异的关键候选基因。结果显示:22头通城猪精液冻存后的精子活力存在明显差异,3头精子耐冻个体之间和3头精子不耐冻个体之间分别具有更近的亲缘关系,表明猪精子耐冻性差异可能受遗传因素影响;对耐冻性差异个体SNP芯片数据的FST分析结果显示,FST平均值为0.170 5,存在较高程度的遗传分化;进一步选取FST前1%(FST>0.53)的266个SNP位点,并在其上下游100 kb区域共注释到了397个候选基因,富集在细胞形态、肌动蛋白细胞骨架和离子通道等生物学过程;其中KCNG4、ARPC1B、DNAAF4、MNS1、LIMK2、RPL31和VIM等基因可作为猪精子耐冻性差异的关键候选基因。以上结果说明,猪精子耐冻性受遗传因素影响,...
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关 键 词: | 猪 精液冷冻保存 精子耐冻性 差异候选基因 SNP芯片 人工授精 |
收稿时间: | 2020-12-23 |
Analysis of candidate genes affecting semen freezability of boar sperm |
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Abstract: | |
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Keywords: | pig semen cryopreservation sperm freezability difference-candidate gene SNP chip artificial insemination |
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