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影响猪精子耐冻性的候选基因分析
引用本文:王文君,王小康,徐国强,周翔,刘榜. 影响猪精子耐冻性的候选基因分析[J]. 华中农业大学学报, 2021, 40(3): 203-211
作者姓名:王文君  王小康  徐国强  周翔  刘榜
作者单位:华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,武汉 430070;华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,武汉 430070;生猪健康养殖省部共建协同创新中心/湖北省地方猪品种改良工程技术研究中心,武汉 430070
基金项目:国家自然科学基金重点项目(31930104)
摘    要:在对通城猪精液冷冻保存的过程中,发现精液冻存质量存在个体差异。根据多次精液冻存后的精子活力检测结果,结合系谱关系筛选出精子耐冻与不耐冻个体各3头,并采用"中芯一号"SNP芯片进行群体遗传分化指数(FST)分析,应用生物信息学方法挖掘影响猪精子耐冻性差异的关键候选基因。结果显示:22头通城猪精液冻存后的精子活力存在明显差异,3头精子耐冻个体之间和3头精子不耐冻个体之间分别具有更近的亲缘关系,表明猪精子耐冻性差异可能受遗传因素影响;对耐冻性差异个体SNP芯片数据的FST分析结果显示,FST平均值为0.170 5,存在较高程度的遗传分化;进一步选取FST前1%(FST>0.53)的266个SNP位点,并在其上下游100 kb区域共注释到了397个候选基因,富集在细胞形态、肌动蛋白细胞骨架和离子通道等生物学过程;其中KCNG4、ARPC1B、DNAAF4、MNS1、LIMK2、RPL31和VIM等基因可作为猪精子耐冻性差异的关键候选基因。以上结果说明,猪精子耐冻性受遗传因素影响,...

关 键 词:  精液冷冻保存  精子耐冻性  差异候选基因  SNP芯片  人工授精
收稿时间:2020-12-23

Analysis of candidate genes affecting semen freezability of boar sperm
Abstract:
Keywords:pig   semen cryopreservation   sperm freezability   difference-candidate gene   SNP chip   artificial insemination
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