葡萄bHLH转录因子家族全基因组分析 |
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引用本文: | 尹欢,蔡斌,李成慧,陈飞.葡萄bHLH转录因子家族全基因组分析[J].江西农业学报,2013(9). |
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作者姓名: | 尹欢 蔡斌 李成慧 陈飞 |
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作者单位: | 1. 南京农业大学 园艺学院,江苏 南京,210095 2. 苏州农业职业技术学院,江苏 苏州,215008 |
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基金项目: | 农业部“948”项目(2011-G21)。 |
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摘 要: | 通过生物信息学的方法,鉴定得到110个葡萄的bHLH基因,分别命名为VvbHLH001VvbHLH110。葡萄bHLH基因可以分为24个亚家族,以非随机的方式分布在19条染色体上,其中有10组基因发生了串联复制。基因芯片表达分析显示葡萄bHLH基因具有器官特异性表达,如亚家族Ib(2)在根中特异表达,可能与根活力有关;VvbHLH003和VvbHLH16基因在花蕊及花序中特异表达,推测与花器官发育有关。研究结果可为进一步开展bHLH家族的基因功能和分子进化机制的研究提供基础。
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关 键 词: | 葡萄 bHLH 转录因子 生物信息学 |
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