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应用焦磷酸测序鉴定马铃薯感染的马铃薯Y病毒株系
引用本文:刘洪义 梁五生 刘忠梅 张洪祥 杨立群. 应用焦磷酸测序鉴定马铃薯感染的马铃薯Y病毒株系[J]. 中国农学通报, 2013, 29(36): 140-146. DOI: 10.11924/j.issn.1000-6850.2013-2442
作者姓名:刘洪义 梁五生 刘忠梅 张洪祥 杨立群
作者单位:1. 黑龙江出入境检验检疫局检验检疫技术中心2. 浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所
基金项目:国家质量监督检验检疫总局科技计划项目;国家自然科学基金资助项目
摘    要:为了检验是否可以通过焦磷酸测序法进行短序列测序,来鉴别马铃薯Y病毒(PVY)株系,从NCBI库中选取了代表9个PVY株系的全基因组序列30个,通过比对P1和CP蛋白的氨基酸序列,分别找出一个差异区段,针对这2个区域设计了反转录引物、PCR引物和测序引物。分别从黑龙江省克山县和讷河市各采集了一份马铃薯病叶样品,通过提取总RNA,反转录,再进行PCR扩增获得扩增产物,并对扩增产物进行了焦磷酸测序。测序结果显示,尽管两份马铃薯病叶症状不同,但均感染了PVY(N-Wi株系)(PVYN-Wi)。上述研究表明,利用本试验设计的引物,通过焦磷酸测序法进行短序列测序,可以鉴定马铃薯感染的PVY株系。

关 键 词:正交试验  正交试验  
收稿时间:2013-09-12
修稿时间:2013-09-27

Identification of Potato virus Y Strains in Infected Potato Plants by Pyrosequencing
Liu Hongyi,Liang Wusheng,Liu Zhongmei,Zhang Hongxiang,Yang Liqun. Identification of Potato virus Y Strains in Infected Potato Plants by Pyrosequencing[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2013, 29(36): 140-146. DOI: 10.11924/j.issn.1000-6850.2013-2442
Authors:Liu Hongyi  Liang Wusheng  Liu Zhongmei  Zhang Hongxiang  Yang Liqun
Affiliation:(Technical Center of lnspection and Quarantine/State Key Testing Laboratory of Potato Viruses of China, Heilongfiang Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Harbin 150001; 2Institute of Biotechnology/State Key Laboratory of Rice Biology, College of Agriculture and Biotechnology, Zhejiang University, H angzhou 310058)
Abstract:
Keywords:pyrosequencing
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