| 冬瓜 WRKY 基因家族鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 赵添悦,蔡金森,王 敏,谢大森,杨松光,崔晓娟,高苏娟. 冬瓜 WRKY 基因家族鉴定及表达分析[J]. 广东农业科学, 2024, 51(2): 39-52 |
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| 作者姓名： | 赵添悦 蔡金森 王 敏 谢大森 杨松光 崔晓娟 高苏娟 |
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| 作者单位： | 1. 仲恺农业工程学院轻工食品学院，广东 广州 510225；2. 广东省农业科学院蔬菜研究所 /广东省蔬菜新技术研究重点实验室，广东 广州 510640 |
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| 基金项目： | 广东省蔬菜新技术研究重点实验室开放课题基金（202001） |
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| 摘 要： | 【目的】WRKY转录因子家族在植物生长发育、抵御胁迫等过程起着至关重要的作用。挖掘参与冬瓜（Benincasa hispida Cogn.）非生物胁迫的WRKY基因家族成员，探究其生物学功能。【方法】基于冬瓜基因组数据库鉴定冬瓜WRKY成员，利用生物信息学的方法系统分析其WRKY基因家族成员的蛋白理化性质、系统发育、保守基序、顺式作用元件，通过qPCR分析冬瓜WRKY的表达情况。【结果】冬瓜WRKY基因家族有57个成员，氨基酸数目在126～650之间，相对分子质量在13.92～71.68 kD之间；蛋白等电点在4.61～9.69之间。根据系统进化树将该家族分为3个类群，第二类群又分为5个亚组。冬瓜WRKY外显子有2～6个。染色体定位分析发现，有56个基因定位在12条染色体上，1个基因未定位在染色体上。保守基序分析显示，Motif 1和Motif 3存在于56个基因，且同一类群具有类似的保守基序结构。同时，冬瓜WRKY基因的启动子上均含有应激反应相关元件、激素响应元件。WRKY在冬瓜不同组织和果实发育时期特异表达。RT-PCR结果表明非生物胁迫和激素处理冬瓜可诱导部分WRKY基因的表达。...
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| 关 键 词： | 冬瓜 WRKY基因家族 生物信息学 系统发育分析 表达分析 |
Identification and Expression Analysis of the WRKY Gene Family in Wax Gourd |
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| ZHAO Tianyue,CAI Jinsen,WANG Min,XIE Dasen,YANG Songguang,CUI Xiaojuan,GAO Sujuan. Identification and Expression Analysis of the WRKY Gene Family in Wax Gourd[J]. Guangdong Agricultural Sciences, 2024, 51(2): 39-52 |
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| Authors: | ZHAO Tianyue CAI Jinsen WANG Min XIE Dasen YANG Songguang CUI Xiaojuan GAO Sujuan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | wax gourd WRKY gene family bioinformatics phylogenetic analysis expression analysis |
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