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棉花根际促生菌基因组DNA的提取及其鉴定
引用本文:王彦芹,席琳乔.棉花根际促生菌基因组DNA的提取及其鉴定[J].广西农业生物科学,2010(5).
作者姓名:王彦芹  席琳乔
作者单位:塔里木大学生命科学学院 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室 塔里木大学动物科技学院
基金项目:教育部重点项目(207139);; 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室开放课题(BR0506)共同资助
摘    要:植物根际微生物基因组的提取往往因为细胞壁不能完全裂解以及内含物的成分和含量受到影响,获得完整的基因组DNA一直是土壤微生物分子生物学研究的关键。本文以新疆盐碱地棉花根际促生菌为材料,比较了SDS法、CTAB法以及高盐结合的CTAB法提取棉花根际促生菌基因组DNA的效率,结果显示,SDS法和CTAB法在细胞裂解后,由于过多的多糖类物质混于上清液中使其过于粘稠而无法分层,没能得到DNA样品。高盐结合的CTAB法则有效弥补了上述方法的不足,能够获得A260/A280为1.82、A260/A230为2.43的高质量基因组DNA。同时实验还以细菌16SrDNA为内标进行PCR扩增,结果证明所获得的棉花根际促生菌基因组DNA可直接用于PCR等分子生物学进一步研究。

关 键 词:棉花根际促生菌  高盐结合CTAB法  基因组DNA  提取  鉴定

Genomic DNA Extraction and Its Identification of Promoting Bacteria from Cotton Roots
Wang Yanqin,;,Xi Linqiao.Genomic DNA Extraction and Its Identification of Promoting Bacteria from Cotton Roots[J].Journal of Guangxi Agricultural and Biological Science,2010(5).
Authors:Wang Yanqin  ;  Xi Linqiao
Institution:1 College of Life Science; Tarim University; Alar; 843300; 2 Key Laboratory of Protection and Utilization of Biological Resource in Tarim Basin of Xinjiang Production & Construction Groups; 3 College of Animal Science and Technology;
Abstract:Because of cell wall could not be completely lysated and the composition and content of nclusions, the genomic DNA extraction of plant microorganism from roots is influenced, obtaining complete genome DNA is always the key of investigating molecular biology of soil microorganism. In this paper, we employed the growth promoting rhizobacteria from cotton roots as the experiment material, and compared the genome DNA efficiency of growth promoting rhizobacteria from cotton roots that extracted by SDS method, CT...
Keywords:Promoting bacteria from cotton roots  High salt-CTAB method  Genome DNA  Extraction  Identification
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