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番茄GRX基因家族的鉴定及表达分析
引用本文:苏慧慧,李涛,黎振兴,李植良,王永飞. 番茄GRX基因家族的鉴定及表达分析[J]. 核农学报, 2015, 29(4)
作者姓名:苏慧慧  李涛  黎振兴  李植良  王永飞
作者单位:1. 暨南大学生命科学技术学院,广东广州510532;广东省农业科学院蔬菜研究所,广东广州510640
2. 广东省农业科学院蔬菜研究所,广东广州,510640
3. 暨南大学生命科学技术学院,广东广州,510532
摘    要:GRX基因家族是从原核生物到真核生物中普遍存在的一类巯基-二硫键氧化还原酶,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中均发挥重要作用.本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄的GRX基因组家族的成员、分布及结构和功能等进行分析.预测结果显示,番茄GRX家族包含55个蛋白质,分为4个亚族,其中植物特有的CC亚族成员最多,有35个,其他GRX基因成员与拟南芥GRX家族具有相似分类.在番茄GRX结构域中包含12个重要的基序,主要分布在序列的N端,相同亚族中的GRX成员蛋白序列的氨基酸保守域构成基本一致,且各亚族成员的氨基酸保守域组成特异,表明这些基序的存在对GRX蛋白功能的执行是必需的.利用实时荧光定量PCR对番茄GRX基因的组织表达和胁迫响应分析,结果表明,GRX基因具有组织特异性表达差异,CC型在根和花中表达较高,在果实中表达较低;在盐、SA、ABA、高温和低温胁迫条件下,22个番茄GRX基因的表达模式被阐明;其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,很可能参与了调控番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应.本研究结果将为番茄GRX家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析GRX基因功能奠定基础.

关 键 词:番茄  GRX基因家族  生物信息学  表达分析

Identification and Gene Expression Analysis of GRX Gene Family in Tomato
SU Huihui,LI Tao,LI Zhenxing,LI Zhiliang,WANG Yongfei. Identification and Gene Expression Analysis of GRX Gene Family in Tomato[J]. Acta Agriculturae Nucleatae Sinica, 2015, 29(4)
Authors:SU Huihui  LI Tao  LI Zhenxing  LI Zhiliang  WANG Yongfei
Abstract:
Keywords:tomato  Glutaredoxins family  bioinformatics  gene expression
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