基于gB基因的IBRV微滴式数字PCR检测方法的建立及初步应用 |
| |
引用本文: | 高雅欣,刘立兵,刘岳林,王金凤,王建昌,李睿文.基于gB基因的IBRV微滴式数字PCR检测方法的建立及初步应用[J].中国兽医学报,2023(3):469-475. |
| |
作者姓名: | 高雅欣 刘立兵 刘岳林 王金凤 王建昌 李睿文 |
| |
作者单位: | 1. 河北农业大学动物医学学院;2. 石家庄海关技术中心 |
| |
基金项目: | 河北省科研基金资助项目(19226636D); |
| |
摘 要: | 为实现牛传染性鼻气管炎病毒(infectious bovine rhinotracheitis virus, IBRV)精准的定量检测,以IBRV gB基因为靶基因,建立IBRV微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)定量检测方法,进行了ddPCR退火温度、引物和探针浓度的优化、特异性和灵敏性试验。结果显示,建立的ddPCR方法最佳退火温度为56.5℃;反应体系中最佳引物、探针浓度分别为900和250 nmol/L;能够实现IBRV的特异性检测,与其他常见的牛呼吸系统疫病病原无交叉反应;以重组质粒pMD19-T-gB为模板,ddPCR方法的检出限为1.8 copies/μL,是实时荧光PCR方法敏感性的10倍。对119份具有呼吸道症状的牛鼻拭子样本分别进行ddPCR方法和实时荧光PCR方法进行检测,结果显示,ddPCR方法和实时荧光PCR方法的检出率分别为(15.13%,18/119)和(12.60%,15/119)。本研究建立的ddPCR方法特异性强、灵敏度高,可作为牛呼吸道临床样品中IBRV精准定量检测的有效手段。
|
关 键 词: | 牛传染性鼻气管炎病毒 微滴式数字PCR gB基因 定量检测 |
|
|