1株大鲵源多重耐药维氏气单胞菌全基因组解析及其致病性

为明晰重庆地区1株大鲵源多重耐药维氏气单胞菌的生物特征，本试验对分离菌中CQ-AV1株进行了全基因组测序以及致病性分析。利用二代测序技术中Illumina HiSeq测序平台对分离菌进行全基因测序，测序数据经修剪、过滤、去除接头和低质量碱基后，以HGA V1.0软件进行组装并上传至GenBank,并与数据库中已有序列构建系统进化树；利用VFDB(virulence factors of pathogenic bacteria)和CGE(center for genomic epidemiology)数据库对其毒力基因和耐药基因进行注释；将菌株分别腹腔注射健康小鼠和大鲵，观察其对2种实验动物的致病情况，并对发病大鲵的肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织进行病理切片，观察其病理组织学变化。结果显示，CQ-AV1株基因组长度为4 782 590 bp, GC含量为58.48%,共编码4 323个基因，另有假基因62个，GenBank中的注册号为RZII00000000.1;系统进化树显示该菌与猪源维氏气单胞菌菌株具有最近的亲缘关系，与鲈鱼源和罗非鱼源菌株亲缘关系次之，与人源菌株亲缘关系最远；致病性试验...