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玉米穗轴长与穗轴粗的QTL定位及全基因组预测
引用本文:李宗泽,徐晓明,孙强,杨彩霞,许加波,吴鹏昊. 玉米穗轴长与穗轴粗的QTL定位及全基因组预测[J]. 中国农业大学学报, 2022, 27(4): 44-52
作者姓名:李宗泽  徐晓明  孙强  杨彩霞  许加波  吴鹏昊
作者单位:新疆农业大学 农学院, 乌鲁木齐 830052
基金项目:国家自然科学基金(32060484);国家自然科学基金(U2003304)
摘    要:为明确玉米穗部发育相关性状的主效QTL位点,利用玉米自交系‘B73’与‘郑58’构建F2群体,采用48K液相杂交捕获探针进行基因型鉴定,结合多个环境下测得的表型数据对玉米穗轴长与穗轴粗进行QTL定位和全基因组预测。结果表明:穗轴长与穗轴粗在基因型、环境、基因型与环境的互作3个变异项均具有显著差异,穗轴长性状与穗轴粗性状的广义遗传力分别是0.71与0.52。穗轴长共检测到8个QTL,表型贡献率为3.54%~12.64%,在3号染色体检测1个新的主效QTL,即qCL3,LOD为8.31,表型贡献率为12.64%。穗轴粗共检测到3个QTL,表型贡献率为7.92%~10.61%,在4号染色体上检测到1个新的主效QTL,即qCD4-1,LOD为5.14,表型贡献率为10.61%。穗轴长与穗轴粗全基因预测的精度分别为0.56和0.39,全基因组预测精度随着训练群体和标记数目的增加而增加,当训练群体大小达到总群体的60%、标记密度达到500个时,预测精度增加幅度变缓。

关 键 词:玉米;穗轴长;穗轴粗;QTL定位;全基因组预测
收稿时间:2020-04-20

QTL mapping and genomic selection of cob length and diameter in maize
LI Zongze,XU Xiaoming,SUN Qiang,YANG Caixi,XU Jiabo,WU Penghao. QTL mapping and genomic selection of cob length and diameter in maize[J]. Journal of China Agricultural University, 2022, 27(4): 44-52
Authors:LI Zongze  XU Xiaoming  SUN Qiang  YANG Caixi  XU Jiabo  WU Penghao
Affiliation:College of Agronomy, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052, China
Abstract:
Keywords:maize   cob length   cob diameter   QTL mapping   genomic selection
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