| 制干辣椒SCoT-PCR体系优化及引物筛选 |
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| 引用本文： | 李宁,杨涛,杨生保,唐亚萍,王柏柯,王强,帕提古丽,余庆辉.制干辣椒SCoT-PCR体系优化及引物筛选[J].广西农业科学,2015,46(4). |
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| 作者姓名： | 李宁 杨涛 杨生保 唐亚萍 王柏柯 王强 帕提古丽 余庆辉 |
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| 作者单位： | 新疆农业科学院园艺作物研究所,乌鲁木齐,830091 |
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| 基金项目： | 新疆公益性科研院所基本科研业务经费专项项目，大宗蔬菜产业技术体系乌鲁木齐试验站建设项目，新疆农业科学院青年基金项目 |
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| 摘 要： | 目的]优化制干辣椒SCoT-PCR反应体系,为新疆制干辣椒种质资源、分子遗传学研究奠定基础.方法]以制干辣椒为材料,采用L25(55)正交设计方法对影响制干辣椒SCoT-PCR反应体系的Mg2+、模板DNA、引物、DNA聚合酶、dNTPs等因素进行优化筛选.结果]从25个正交设计组合中筛选获得5个组合的扩增效果较好,扩增条带丰富且清晰度适中、分散性好;经引物SC-12、SC-13、SC-19筛选,获得适用于制干辣椒材料的SCoT-PCR最佳反应体系20.0 μL,包含10×Buffer 2.0 μL、30 ng模板DNA 0.8 μL、2.0 mmol/L Mg2+ 1.8μL、1.0 μmol/L引物1.0 μL、1 U Taq DNA聚合酶0.4μL、0.25 mmol/L dNTPs 0.5 μL、ddH2O 13.5 μL.运用优化体系从80条引物中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SCoT引物24条.结论]优化的SCoT-PCR反应体系及筛选的引物可用于新疆制干辣椒种质鉴定、遗传图谱构建、遗传多样性的分析等.
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| 关 键 词： | 制干辣椒 SCoT标记 正交设计 体系优化 |
Optimization of SCoT-PCR System and primers screening of dried-usage chili(Capsicum annuum L.) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | dried-uage chili SCoT orthogonal design system optimization |
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