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陆地棉两个GhBI-1基因的生物信息学分析
引用本文:郑玲,霍雪寒,王芙蓉,张军.陆地棉两个GhBI-1基因的生物信息学分析[J].山东农业科学,2011(3):4-7.
作者姓名:郑玲  霍雪寒  王芙蓉  张军
作者单位:1. 山东师范大学生命科学学院,山东,济南,250014;国家棉花改良中心山东分中心/山东棉花研究中心,山东,济南,250100
2. 国家棉花改良中心山东分中心/山东棉花研究中心,山东,济南,250100
基金项目:国家转基因生物新品种培育重大专项,国家"863"计划项目,"十一五"国家科技支撑计划项目
摘    要:BI-1基因是广泛存在于真核生物、原核生物和病毒中的一个保守性基因,具有抑制细胞凋亡的作用。本研究对克隆到的两个陆地棉BI-1基因——GhBI-1a和GhBI-1b进行生物信息学分析,发现其与拟南芥BI-1有很高的同源性,尤其羧基尾极为相似。GhBI-1a有6个跨膜区域,GhBI-1b有7个跨膜区域,它们的二级结构也与其他物种的BI-1相似,跨膜区域基本都是α螺旋。

关 键 词:陆地棉  BI-1基因  cDNA  生物信息学

Bioinformatic Analysis on Two GhBI-1 Genes of Upland Cotton
ZHENG Ling,HUO Xue-han,WANG Fu-rong,ZHANG Jun.Bioinformatic Analysis on Two GhBI-1 Genes of Upland Cotton[J].Shandong Agricultural Sciences,2011(3):4-7.
Authors:ZHENG Ling  HUO Xue-han  WANG Fu-rong  ZHANG Jun
Institution:ZHENG Ling1,2,HUO Xue-han1,WANG Fu-rong2,ZHANG Jun1,2(1.College of Life Science,Shandong Normal University,Jinan 250014,China,2.Shandong Subcenter of National Cotton Improvement Center of China/Shandong Cotton Research Center,Jinan 250100,China)
Abstract:BI-1 gene,which widely exists in eukaryotes,prokaryotes and virus,is a conservative gene and has a function of inhibiting cell apoptosis.Two BI-1 genes from upland cotton,named GhBI-1a and GhBI-1b,were studied by bioinformatic analysis.The results showed that they had high homology with BI-1 gene from Arabidopsis,especially at the carboxyl tail.GhBI-1a had 6 transmembrane domains,while GhBI-1b had 7.Their secondary structure were similar with other species.The transmembrane domains were α spiral.
Keywords:cDNA
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