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苏云金芽胞杆菌cry1Ib2基因的克隆与生物信息学分析
引用本文:关夏玉,张永嵘,黄天培,关雄. 苏云金芽胞杆菌cry1Ib2基因的克隆与生物信息学分析[J]. 热带作物学报, 2010, 31(8): 1266-1271. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.08.006
作者姓名:关夏玉  张永嵘  黄天培  关雄
作者单位:1. 福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室,福建福州,350002;福建农林大学园艺学院,福建福州,350002
2. 福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室,福建福州,350002;福建农林大学生命科学学院,福建福州,350002
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划),卫生部科学研究基金,福建省高校服务海西建设重点项目(闽教高 
摘    要:BRC-ZLL4是一株从鱼尾葵(Cargota mitis Lour)上分离到的,对柑橘凤蝶幼虫具有毒性的苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)菌株。本试验采用PCR-RFLP技术鉴定该菌株中含有cry1Ib基因。设计一对特异引物,分别引入SalⅠ和BamHⅠ酶切位点,以BRC-ZLL4的总DNA为模板,扩增cry1Ib全长基因。生物信息学分析表明,该基因全长2160bp,编码一个由719个氨基酸组成的、相对分子质量为81.39ku、等电点为6.425的蛋白。该基因已在GenBank上登录(登录号为EU233027),并被Btδ-内毒素国际命名委员会正式命名为cry1Ib2。信号肽预测显示,Cry1Ib2蛋白没有信号肽,为胞内蛋白。二级结构预测显示,在Cry1Ib2蛋白二级结构中,25%为α-螺旋,28%为β-片层,18%为β-转角,29%为无规则线圈。此外还对Cry1Ib蛋白的功能区和三级结构进行了预测和分析。

关 键 词:苏云金芽胞杆菌  cry1Ib2基因  克隆  生物信息学

Cloning and Bioinformatics of cry1Ib2 Gene from Bacillus thuringiensis
Guan Xiayu,Zhang Yongrong,Huang Tianpei and Guan Xiong. Cloning and Bioinformatics of cry1Ib2 Gene from Bacillus thuringiensis[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2010, 31(8): 1266-1271. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.08.006
Authors:Guan Xiayu  Zhang Yongrong  Huang Tianpei  Guan Xiong
Affiliation:1 Fujian Agriculture and Forestry University / Key Laboratory of Biopesticide and Chemical Biology,2 College of Horticulture, Fujian Agriculture and Forestry University;1 Fujian Agriculture and Forestry University / Key Laboratory of Biopesticide and Chemical Biology,Ministry of Education 3 College of life science, Fujian Agriculture and Forestry University;1 Fujian Agriculture and Forestry University / Key Laboratory of Biopesticide and Chemical Biology,Ministry of Education 3 College of life science, Fujian Agriculture and Forestry University;1 Fujian Agriculture and Forestry University / Key Laboratory of Biopesticide and Chemical Biology,Ministry of Education 3 College of life science, Fujian Agriculture and Forestry University
Abstract:
Keywords:Bacillus thuringiensis   cry1Ib2 gene   Cloning   Bioinformatics
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