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禽坦布苏病毒TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立
引用本文:万春和,陈翠腾,傅秋玲,等. 禽坦布苏病毒TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2016, 44(8): 49-54
作者姓名:万春和  陈翠腾  傅秋玲  
作者单位:福建省农业科学院 畜牧兽医研究所 福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心,福建省农业科学院 畜牧兽医研究所 福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心,福建省农业科学院 畜牧兽医研究所 福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心
基金项目:国家现代水禽产业体系项目(CARS-43);福建省属公益类项目(2015R1023-7);福建省农业科学院“青年科技英才百人计划”项目(YC2015-12);福建省农业科学院青年人才创新基金项目(2014QA-7)
摘    要:【目的】建立禽坦布苏病毒(Avian Tembusu virus,ATmV)TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。【方法】根据ATmV非结构蛋白NS1的基因特征,设计特异性的引物和探针,建立基于TaqMan探针检测ATmV的实时荧光定量PCR检测方法,对其特异性、重复性进行检测。用建立的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法和之前建立的RT-PCR方法同时对临床15份疑似ATmV感染的病料进行检测,计算其符合率。【结果】成功建立了检测ATmV的实时荧光定量PCR检测方法,当NS1基因含量为(2.67×102)~(2.67×107)拷贝/μL时有良好的线性扩增,其扩增相关系数为0.998,扩增效率为99.9%。建立的ATmV实时荧光定量PCR检测方法敏感度高,最低检测限为2.67×102拷贝/μL;特异性强,对水禽常见病毒(如Ⅰ型鸭肝炎病毒、新型鸭呼肠孤病毒、禽流感病毒、禽Ⅰ型副粘病毒与番鸭细小病毒等)检测均为阴性;重复性好,组内变异系数和组间变异系数分别为0.39%~1.17%和0.51%~1.82%。对临床送检的15份病料,TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的阳性率为73.33%(11/15),RTPCR方法的阳性率为60.0%(9/15),2种方法的符合率为100.0%。【结论】建立了基于TaqMan探针的ATmV实时荧光定量PCR检测方法,该方法可应用于ATmV感染的早期检测。

关 键 词:禽坦布苏病毒;NS1基因;TaqMan;实时荧光定量PCR方法
收稿时间:2014-12-16

Development of a TaqMan-based real-time PCR method for avian Tembusu virus
WAN Chunhe,CHEN Cuiteng and FU Qiuling,et al. Development of a TaqMan-based real-time PCR method for avian Tembusu virus[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2016, 44(8): 49-54
Authors:WAN Chunhe  CHEN Cuiteng  FU Qiuling  et al
Abstract:
Keywords:avian Tembusu virus  NS1 gene  TaqMan  real time PCR method
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