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白菜类作物氮利用效率的关联分析
引用本文:翟文,林良斌,李石开,丁建明,汪骞,程锋,王晓武,武剑. 白菜类作物氮利用效率的关联分析[J]. 中国蔬菜, 2011, 1(18): 16-24
作者姓名:翟文  林良斌  李石开  丁建明  汪骞  程锋  王晓武  武剑
作者单位:1.云南农业大学农学与生物技术学院,云南昆明 650201,2中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京 100081,3云南省农业科学院园艺作物研究所,云南昆明650205,4东北农业大学,黑龙江哈尔滨 150030
基金项目:Seventh Framework Programme for Research,Technological Development and Demonstration:Integrated Project NUE-CROPs(FP7-CP-IP222645)
摘    要:为了研究白菜类作物氮利用效率遗传机制,定位与氮利用效率紧密相关的标记位点,利用分布于白菜全基因组的207个InDel标记,对160份有代表性的白菜类作物自然群体的基因组变异进行扫描,采用混合模型分析该群体的遗传结构,并应用TASSEL软件的GLM(General Linear Model)程序对叶片形态、植株形态和生物量相关的10个性状分别在两个氮处理水平进行关联分析。结果表明:InDel数据遗传结构分析将160个单株分为5个亚群体。关联分析结果表明:云南和北京的试验分别检测出45个和35个显著性相关标记,其中4个标记为两年共定位,平均贡献率为0.06。值得注意的是,关联到86个显著性变异位点只在一个氮水平被检测到,可能是氮处理水平的变化影响了某些相关基因的表达调控。

关 键 词:白菜类作物  关联分析  氮利用效率  

Association Analysis of Nitrogen Use Efficiency (NUE) In Brassica campestris L.
ZHAI Wen , LIN Liang-bin , LI Shi-kai , DING Jian-ming , WANG Qian , CHENG Feng , WANG Xiao-wu , WU Jian. Association Analysis of Nitrogen Use Efficiency (NUE) In Brassica campestris L.[J]. China Vegetables, 2011, 1(18): 16-24
Authors:ZHAI Wen    LIN Liang-bin    LI Shi-kai    DING Jian-ming    WANG Qian    CHENG Feng    WANG Xiao-wu    WU Jian
Affiliation:1.College of Agronomy and Biotechnology,Yunnan Agricultural University,Kunming 650201,Yunnan,China|2Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China|3Institute of Horticulture,Yunnan Academy of Agricultural Sciences,Kunming 650205,Yunnan,China|4Northeast Agricultural University,Harbin 150030,Heilongjiang,China
Abstract:In order to illustrate the genetic mechanism of nitrogen use efficiency(NUE)and identify the gene-linked markers for NUE in Brassica campestris L.,we genotyped 160 representative B.campestris accessions using 207 Insertion/Deletion(InDel)locus evenly distributed along the genome.Population structure was firstly analyzed for the population,then the structure-based association analysis between InDel locus and 10 leaf morphology and biomass traits in two contrasting N environments was performed by using TASSEL...
Keywords:Brassica campertris L.  Association analysis  Nitrogen use efficiency (NUE)  
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