绒山羊RORα基因2种亚型的结构与进化分析 |
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作者姓名: | 吴江鸿 刘永志 孙海莲 张文广 |
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作者单位: | 1. 内蒙古农牧业科学院/中国科学院内蒙古草业研究中心,呼和浩特010031……l~…—……~……一.-一 内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室,呼和浩特010018 2. 内蒙古农牧业科学院/中国科学院内蒙古草业研究中心,呼和浩特010031……l~…—……~……一.-一 3. 内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室,呼和浩特,010018 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目,国家科技支撑计划项目,科技部农业科技成果转化资金项目,国家农业产业体系项目 |
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摘 要: | 为深入研究绒山羊RORα基因的结构及功能,利用cDNA末端快速扩增法(RACE)结合转录组获得了绒山羊(Capra hircus)维甲酸相关孤核受体(retinoic acid receptor-related orphan receptorα,RORα)基因的2个亚型:RORα1和RORα2(GenBank登录号分别是HM061155和HM358053)。序列分析表明,RORα1序列全长1 620bp,包括5′端非翻译区(untranslated region,UTR)29bp、3′端非翻译区211bp和开放阅读框(open reading frame,ORF)1 380bp,共编码459个氨基酸,分子质量约为52.3ku,理论等电点6.25。RORα2序列全长1 694bp,包括5′UTR 76bp、3′UTR 211bp和ORF 1 407bp,共编码468个氨基酸;与人RORα4的长度相同,相似性达99%,分子质量约为53.4ku,理论等电点为6.37。结果显示:1)RORα1氨基酸序列缺少大多数核受体具有的调节区(A/B区),预测的二级结构少一个β-折叠基序(YFV);2)RORα的DNA结合区到配体结合区部分属于纯化选择,A/B区在长度和序列方面变异都很大。
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关 键 词: | 绒山羊 RORα基因 RACE 编码蛋白 进化 |
收稿时间: | 2012-01-08 |
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