首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

烟草MITE位点间多态性(IMP)标记开发及其遗传作图应用
引用本文:高玉龙,桂毅杰,肖炳光,薄世平,严广号,樊龙江.烟草MITE位点间多态性(IMP)标记开发及其遗传作图应用[J].浙江大学学报(农业与生命科学版),2012,38(6).
作者姓名:高玉龙  桂毅杰  肖炳光  薄世平  严广号  樊龙江
作者单位:1. 云南省烟草农业科学研究院,云南玉溪,653100
2. 浙江大学农业与生物技术学院农学系,浙江杭州,310058
基金项目:云南省科技厅资助项目,云南省烟草公司资助项目
摘    要:为在烟草(Nicotiana tabacum)上进行IMP (inter-MITE polymorphism,MITE位点间多态性)标记开发,利用美国烟草基因组测序数据和MITE (miniature inverted repeat transposable element,微型反向重复转座元件)结构特征,通过生物信息学方法获得11 581组具有特异TIR (terminal inverted repeat,末端重复元件)序列的MITE及其多序列联配结果,并根据联配结果设计219条烟草IMP引物;利用9个不同类型烟草代表性品种进行测试,其中119条引物PCR扩增成功,引物开发成功率为54.6%;进一步对一个烤烟遗传群体亲本‘红花大金元’和‘Hicks Broadleaf'进行标记筛选,共获得29个多态性标记,群体检测表明有21个标记可以整合定位到一个SSR标记遗传连锁图上.说明IMP标记在烟草中是一种可以利用的分子标记,但跟其他标记一样表现出较低的多态性,需高通量检测平台与之配套来提高其开发效率.

关 键 词:烟草  微型反向重复转座元件(MITE)  MITE位点间多态性(IMP)  分子标记  遗传图谱

Development of tobacco inter-MITE polymorphism (IMP) markers and its application in genetic mapping
GAO Yu-long,GUI Yi-jie,XIAO Bing-guang,BO Shi-ping,YAN Guang-hao,FAN Long-jiang.Development of tobacco inter-MITE polymorphism (IMP) markers and its application in genetic mapping[J].Journal of Zhejiang University(Agriculture & Life Sciences),2012,38(6).
Authors:GAO Yu-long  GUI Yi-jie  XIAO Bing-guang  BO Shi-ping  YAN Guang-hao  FAN Long-jiang
Abstract:
Keywords:
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号