| 转录组测序研究三角帆蚌珍珠颜色相关基因 |
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| 引用本文： | 毛媛媛,郑荣泉,张启鹏,梅祎芸,孔绅绅,刘志芳. 转录组测序研究三角帆蚌珍珠颜色相关基因[J]. 水产学报, 2018, 42(3): 322-333 |
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| 作者姓名： | 毛媛媛 郑荣泉 张启鹏 梅祎芸 孔绅绅 刘志芳 |
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| 作者单位： | 浙江师范大学生化学院,浙江师范大学生化学院,浙江师范大学生化学院,浙江师范大学生化学院,浙江师范大学生化学院,浙江师范大学生化学院 |
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| 基金项目： | 浙江省十二五水产育种专项（2012C12907-9；2012C12907-5） |
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| 摘 要： | 为筛选影响三角帆蚌珍珠颜色的候选基因,采用转录组测序平台Illumina Hi Seq TM2500对蚌壳珍珠层颜色为紫色和白色的三角帆蚌中央膜组织进行高通量测序。所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、COG、KOG、KEGG、GO和Pfam数据库中注释,并进行差异基因聚类分析。结果显示,获得干净数据共72 800 581 bp,拼接获得了89 529个Unigene,差异表达基因2644个,其中上调表达基因1323个,下调表达基因1321个。根据GO功能分类可分为分子功能、细胞组分、生物过程等3大类50分支;根据KEGG代谢通路分析可以分为187类。对差异表达基因分析发现,部分基因与色素合成(眼黄素、黑色素、喋啶色素)及金属离子转运相关,还有6个细胞色素P450,3个细胞色素b561和1个细胞色素b560。研究表明,这些基因可能在珍珠颜色形成中发挥作用。
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| 关 键 词： | 转录组测序 三角帆蚌 珍珠颜色 差异表达 |
| 收稿时间： | 2016-11-28 |
| 修稿时间： | 2017-04-18 |
Transcriptome sequencing analysis on pearl color related genes in Hyriopsis cumingii |
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| MAO Yuanyuan,ZHENG Rongquan,ZHANG Qipeng,MEI Yiyun,KONG Shenshen and LIU Zhifang. Transcriptome sequencing analysis on pearl color related genes in Hyriopsis cumingii[J]. Journal of Fisheries of China, 2018, 42(3): 322-333 |
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| Authors: | MAO Yuanyuan ZHENG Rongquan ZHANG Qipeng MEI Yiyun KONG Shenshen LIU Zhifang |
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| Affiliation: | College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua,College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua,College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua,College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua,College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua,College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua |
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