| 异育银鲫内参基因的筛选 |
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| 引用本文： | 费越越,南星羽,余路,罗扬,高钟元,许丹.异育银鲫内参基因的筛选[J].水产科学,2020,39(3):306-315. |
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| 作者姓名： | 费越越 南星羽 余路 罗扬 高钟元 许丹 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学,国家水生动物病原库,上海201306;上海海洋大学,农业农村部水生种质资源重点实验室,上海201306;上海海洋大学,国家水生动物病原库,上海201306;上海海洋大学,农业农村部水生种质资源重点实验室,上海201306;上海海洋大学,国家渔业科学教育示范中心,上海201306 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年基金资助项目(31602203). |
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| 摘 要： | 内参基因在实时荧光定量PCR(qRT-PCR)中具有校准的作用,然而鲤疱疹病毒Ⅱ型感染异育银鲫内参基因目前仍未见研究报道。采用qRT-PCR技术检测不同处理条件下异育银鲫组织和尾鳍细胞GAPDH、EF-1α、18S rRNA和β-actin 4个候选内参基因在组织和尾鳍细胞的转录水平,利用软件geNorm、Norm Finder、Best Keeper和Delta Ct分析了其表达量的稳定性,以筛选出健康异育银鲫不同组织以及鲤疱疹病毒Ⅱ型感染的肾脏、脾脏和异育银鲫尾鳍细胞在不同时间均较稳定的内参基因。geNorm稳定值以及4个内参的表达量Ct值分析显示,健康异育银鲫脑、脾脏、肾脏、肌肉、鳃、肠、肝脏和心脏组织中β-actin和EF-1α都是比较稳定的内参基因;鲤疱疹病毒Ⅱ型感染肾脏和尾鳍细胞不同时间点,内参基因β-actin稳定性最佳;鲤疱疹病毒Ⅱ型感染脾脏不同时间点时,EF-1α稳定性最佳。分别以4个候选内参基因为内参分析PIN1基因在肾脏组织不同感染时间的相对表达量,结果进一步证实,PIN1基因在肾脏组织感染不同时间点以β-actin为内参时,其表达量呈下降趋势,与cDNA文库测序中的表达量分析结果一致,各时间点的表达量差异极显著(P<0.01)。本试验结果有利于研究异育银鲫在不同处理条件下基因的表达分析,可为获得精准的结果奠定理论基础。
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| 关 键 词： | 异育银鲫 内参基因 实时荧光定量PCR 尾鳍细胞 |
Screening of Reference Genes in Allogynogenetic Silver Crucian Carp Carassius auratus gibelio |
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| FEI Yueyue,NAN Xingyu,YU Lu,LUO Yang,GAO Zhongyuan,XU Dan.Screening of Reference Genes in Allogynogenetic Silver Crucian Carp Carassius auratus gibelio[J].Fisheries Science,2020,39(3):306-315. |
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| Authors: | FEI Yueyue NAN Xingyu YU Lu LUO Yang GAO Zhongyuan XU Dan |
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| Institution: | (National Pathogen Collection Center for Aquatic Animals, Shanghai 201306, China;Key Laboratory of Aquatic Genetic Resources, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China;National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Carassius auratus gibelio reference gene qRT-PCR GiCF cell |
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