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大白菜GIF蛋白家族的生物信息学分析
引用本文:王凤德,李利斌,李化银,刘立峰,高建伟.大白菜GIF蛋白家族的生物信息学分析[J].山东农业科学,2012,44(1):1-5,10.
作者姓名:王凤德  李利斌  李化银  刘立峰  高建伟
作者单位:山东省农业科学院蔬菜研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心,山东济南,250100
基金项目:"973"前期研究专项项目,山东省优秀中青年科学家科研奖励基金,中国博士后科学基金,山东省博士后创新项目
摘    要:GIF(GRF-interacting factor)家族是一类含有SNH和QG结构域的蛋白质,可与GRF(Growth reg-ulating factor)转录因子蛋白相结合形成功能复合体,通过促进和维持细胞的分裂能力参与调控植物叶器官的发育。本研究系统鉴定了5个大白菜的GIF基因,并对这些基因编码的蛋白质序列进行了保守性和系统进化分析,最后对BrGIF1基因的表达进行了分析。结果表明,所有的大白菜和拟南芥GIF蛋白家族成员都具有高度保守的SNH和QG结构域。在进化上,GIF蛋白家族可分为两个不同的亚家族,并且这种特征在大白菜和拟南芥分离之前就已经形成。在表达模式上,BrGIF1基因在具有较大叶球的白菜自交系以及具有较强细胞分裂能力的组织中的转录表达水平较高。另外,BrGIF1基因的表达受到NAA的诱导和ABA的抑制。这些结果表明大白菜GIF蛋白可能具有和拟南芥GIF蛋白相似的生物学功能,在调控植物器官发育中具有重要作用。

关 键 词:大白菜  GIF蛋白  基因家族  表达模式

Bioinformatic Analysis of GIF Protein Family in Chinese Cabbage
WANG Feng-de , LI Li-bin , LI Hua-yin , LIU Li-feng , GAO Jian-wei.Bioinformatic Analysis of GIF Protein Family in Chinese Cabbage[J].Shandong Agricultural Sciences,2012,44(1):1-5,10.
Authors:WANG Feng-de  LI Li-bin  LI Hua-yin  LIU Li-feng  GAO Jian-wei
Institution:(Vegetable Institute,Shandong Academy of Agricultural Sciences/ Key Lab for Greenhouse Vegetables of Shandong Province/ Shandong Branch of National Vegetable Improvement Center,Jinan 250100,China)
Abstract:
Keywords:Chinese cabbage  GIF protein  Gene family  Expression patterns
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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