水稻干尖线虫SPRYSEC基因的克隆及表达定位分析 |
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作者姓名: | 王步勇 王 峰 李丹蕾 马 玲 陈俏丽 王博文 |
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作者单位: | 东北林业大学林学院,东北林业大学林学院,东北林业大学林学院,东北林业大学林学院,东北林业大学林学院,东北林业大学林学院 |
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基金项目: | 高等学校博士学科点专项科研基金(20100062120002);中央高校基本科研业务专项资金资助(2572015AA09)。 |
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摘 要: | 效应蛋白是线虫食道腺分泌物的重要组分,广泛存在于植物寄生线虫中,在线虫整个生长发育及侵染寄生中起到重要作用。根据水稻干尖线虫转录组测序结果,并通过RACE法从水稻干尖线虫中克隆到一SPRY基因,命名为Ab-SPRYSEC。该序列全长为2089 bp,包含一个1962 bp的开放阅读框(ORF)。预测编码653个氨基酸,蛋白相对分子量为72.009 kDA,理论等电点为4.82,不稳定指数41.5,属于不稳定性蛋白;保守区预测分析表明,该蛋白含有B302_SPRY和CTLH两个保守结构域,属于SPRY超家族;多序列比对分析表明,该基因编码蛋白与马来丝虫的SPRY(XP_001891979.1)蛋白相似度最高为43 %;蛋白结构分析表明,β-折叠与无规则卷曲是Ab-SPRYSEC蛋白主要结构元件;表达定位分析显示,Ab-SPRYSEC基因的表达位置在水稻干尖线虫食道腺附近。Ab-SPRYSEC基因作为水稻干尖线虫一效应因子,可能在水稻干尖线虫侵染宿主中发挥了重要作用。
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关 键 词: | 水稻干尖线虫 SPRYSEC基因 基因克隆 序列分析 原位杂交 |
收稿时间: | 2015-03-23 |
修稿时间: | 2016-01-14 |
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