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少孢节丛孢菌XJ-A1几丁质酶基因的克隆及生物信息学分析
引用本文:赵海龙,孟庆玲,乔 军,贡莎莎,胡政香,刘田莉,才学鹏,陈创夫. 少孢节丛孢菌XJ-A1几丁质酶基因的克隆及生物信息学分析[J]. 西北农业学报, 2015, 24(3): 26-32
作者姓名:赵海龙  孟庆玲  乔 军  贡莎莎  胡政香  刘田莉  才学鹏  陈创夫
作者单位:石河子大学动物科技学院;中国农业科学院兰州兽医研究所
基金项目:国家公益行业(农业)专项子课题(201303037-5);国家自然科学基金(31260601);兵团博士资金(2010JC09)
摘    要:为研究捕食线虫性真菌几丁质酶的功能,在国内首次对少孢节丛孢菌XJ-A1几丁质酶AO-801和AO-483基因进行扩增、克隆及测序,并对其编码蛋白信号肽、疏水性与亲水性、高级结构、功能域进行预测和分析。结果显示,2个不同蛋白均具有典型的几丁质酶催化区保守序列SXGGW和DGXDXDWE,属于糖苷水解酶18家族几丁质酶,无信号肽序列,表明这2个蛋白为非分泌型蛋白,二级结构以无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠为蛋白的主要结构元件,三级结构中有(α/β)8的圆桶形结构。系统发育分析表明,几丁质酶AO-801和AO-483与昆虫病原真菌几丁质酶的亲缘关系更为接近,说明它们所产生的几丁质酶在侵染宿主的过程中发挥着类似的功能,并且不同来源真菌几丁质酶根据分子质量的差异形成3个不同的进化分枝。

关 键 词:少孢节丛孢菌  几丁质酶  基因克隆  生物信息学

Cloning and Bioinformatics Analysis of the Chitinase Gene from Arthrobotrys oligospora XJ-A1
ZHAO Hailong,MENG Qingling,QIAO Jun,GONG Shash,HU Zhengxiang,LIU Tianli,CAI Xuepeng and CHEN Chuangfu. Cloning and Bioinformatics Analysis of the Chitinase Gene from Arthrobotrys oligospora XJ-A1[J]. Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica, 2015, 24(3): 26-32
Authors:ZHAO Hailong  MENG Qingling  QIAO Jun  GONG Shash  HU Zhengxiang  LIU Tianli  CAI Xuepeng  CHEN Chuangfu
Affiliation:ZHAO Hailong;MENG Qingling;QIAO Jun;GONG Shasha;HU Zhengxiang;LIU Tianli;CAI Xuepeng;CHEN Chuangfu;Department of Animal Science And Technology,Shihezi University;Lanzhou Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences;
Abstract:
Keywords:Arthrobotrys oligospora   Chitinase   Gene cloning   Bioinformatics
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