猪肌肉组织中ApoE基因5′调控区甲基化的研究 |
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引用本文: | 李仕新,李加琪,田允波.猪肌肉组织中ApoE基因5′调控区甲基化的研究[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2013,41(6):19-23. |
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作者姓名: | 李仕新 李加琪 田允波 |
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作者单位: | 仲恺农业工程学院 生命科学学院;华南农业大学 动物科学学院;仲恺农业工程学院 生命科学学院 |
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基金项目: | 广东省自然科学基金项目(10451022501005709);国家生猪现代产业技术体系建设专项(CARS-36);广东省科技计划项目(B1101328) |
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摘 要: | 【目的】研究猪肌肉组织中猪载脂蛋白E(Apolipoprotein E,ApoE)基因5′调控区的DNA甲基化状况。【方法】以180日龄长白母猪为试验动物,采集其肌肉组织,提取其DNA,经亚硫酸氢盐修饰后用作PCR反应模板;通过生物信息学预测猪ApoE5′调控区潜在的CpG岛,根据预测结果选用甲基化特异性引物对CpG岛进行PCR扩增,对回收、纯化的PCR产物进行克隆和测序,并与GenBank中的ApoE5′调控区序列进行比对,分析CpG岛的甲基化水平。【结果】生物信息学预测发现,猪ApoE基因5′调控区有2个CpG岛,第1个CpG岛有10个CpG位点,第2个CpG岛有12个CpG位点;PCR扩增获得长度分别为233bp的CpG岛1和288bp的CpG岛2序列,这2个CpG岛均存在着9个甲基化CpG位点。【结论】猪ApoE基因5′调控区是CpG位点的富集区域,2个CpG岛存在不同程度的甲基化。
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关 键 词: | 猪 肌肉组织 ApoE基因 DNA甲基化 CpG岛 |
收稿时间: | 2012/8/17 0:00:00 |
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