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IT-ISJ标记及其在陆地棉遗传图谱构建中的应用
引用本文:郑靓,张正圣,陈利,万群,胡美纯,王威,张轲,刘大军,陈笑,魏新琦. IT-ISJ标记及其在陆地棉遗传图谱构建中的应用[J]. 中国农业科学, 2008, 41(8): 2241-2248. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.08.004
作者姓名:郑靓  张正圣  陈利  万群  胡美纯  王威  张轲  刘大军  陈笑  魏新琦
作者单位:西南大学农学与生物科技学院/农业部生物技术与作物品质改良重点实验室
基金项目:国家自然科学基金项目 , 国家高技术研究发展计划("863"计划)
摘    要:【目的】开发可用于植物遗传多样性分析和遗传图谱构建的新型标记。【方法】根据植物结构基因内含子拼接位点的保守序列,设计扩增内含子的内含子-外显子拼接位点(intron targeted intron-exon splice junction,IT-ISJ)标记引物,并用于陆地棉遗传图谱构建。【结果】利用704个IT-ISJ引物组合,对陆地棉高品质品种渝棉1号和多显性基因标记系T586进行多态性筛选,获得49个多态性引物组合,占筛选引物的7.0%。49个多态性引物组合在(渝棉1号×T586)F2:7重组近交系群体270个系中检测到58个位点。以58个IT-ISJ、150个SSR和8个形态标记进行连锁分析,构建的遗传连锁图包括22个连锁群、113个位点(49个IT-ISJ、62个SSR和2个形态标记)。连锁图覆盖714.5 cM,占棉花基因组的16.1%,标记间平均长度为6.3 cM。【结论】IT-ISJ标记多态性高,可有效地用于陆地棉遗传连锁图谱的构建。

关 键 词:内含子定靶的内含子-外显子拼接位点(IT-ISJ)  陆地棉  遗传图谱  
收稿时间:2007-05-18

IT-ISJ Marker and Its Application in Construction of Upland Cotton Linkage Map
Abstract:
Keywords:
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