| 亚麻COBRA基因家族的鉴定与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 齐燕妮,李闻娟,王利民,赵玮,党照,谢亚萍,张建平.亚麻COBRA基因家族的鉴定与生物信息学分析[J].甘肃农业科技,2019(9):33-38. |
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| 作者姓名： | 齐燕妮 李闻娟 王利民 赵玮 党照 谢亚萍 张建平 |
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| 作者单位： | 甘肃省农业科学院作物研究所 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31760426)资助。 |
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| 摘 要： | COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子。亚麻纤维为韧皮纤维,纤维产量与次生壁中纤维素含量及次生壁加厚密切相关。通过BLASTP和Pfam分析,鉴定到24个亚麻COBRA家族成员,并对其进行基因结构、蛋白理化性质及系统进化等生物信息学分析。结果表明,有22个成员具有跨膜结构域,21个成员具有N-端信号肽,16个成员具有GPI锚定位点,所有蛋白均具有CCVS保守结构域而且都定位在细胞膜。基因结构和系统进化分析表明,亚麻COBRA基因家族分为2个亚家族:COBRA-I和COBRA-II,2个亚家族的基因结构具有明显的差异。
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| 关 键 词： | 亚麻 纤维 COBRA基因家族 序列分析 系统进化分析 |
| 收稿时间： | 2019/7/23 0:00:00 |
Identification and Bioinformatics Analysis of the COBRA Gene Family in Flax |
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| QI Yanni,LI Wenjuan,WANG Limin,ZHAO Wei,DANG Zhao,XIE Yaping,ZHANG Jianping.Identification and Bioinformatics Analysis of the COBRA Gene Family in Flax[J].Gansu Agricultural Science and Technology,2019(9):33-38. |
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| Authors: | QI Yanni LI Wenjuan WANG Limin ZHAO Wei DANG Zhao XIE Yaping ZHANG Jianping |
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