| 普通菜豆SSR反应条件的优化 |
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| 引用本文： | 冯国军,徐启江,李玉花,刘大军.普通菜豆SSR反应条件的优化[J].东北农业大学学报,2007,38(1):27-34. |
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| 作者姓名： | 冯国军 徐启江 李玉花 刘大军 |
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| 作者单位： | 1. 哈尔滨市农业科学院,黑龙江,哈尔滨,150070
2. 东北林业大学生命科学学院,黑龙江,哈尔滨,150040 |
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| 摘 要： | 在作物育种中,SSR是主要农艺性状分子标记及标记辅助育种的一项重要技术。以紫花、八月绿、将军、73-8、96-9、9z622等6个普通菜豆品种为试材,采用改良的SDS法提取了高质量的基因组DNA。为建立适宜的SSR反应体系,对影响SSR-PCR扩增的模板DNA浓度、Mg~(2+)的用量、Taq DNA聚合酶浓度、dNTPs浓度、退火温度等因素进行了优化。结果表明,在25μLPCR反应体系中,DNA模板的最适浓度为0.8ng·μL~(-1),Mg~(2+)的优化浓度为1.5mmol·L~(-1),Taq DNA聚合酶的最适浓度为0.05μmol·(μL·min)~(-1),dNTPs的最适浓度为0.2mmol·L~(-1)。
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| 关 键 词： | 普通菜豆 SSR 反应条件 优化 |
| 文章编号： | 1005-9369（2007）01-0027-08 |
| 修稿时间： | 2005-07-12 |
Optimal condition for simple sequence repeat in common bean (Phaseolus vulgaris L) |
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| FENG Guojun,XU Qijiang,LI Yuhua,LIU Dajun.Optimal condition for simple sequence repeat in common bean (Phaseolus vulgaris L)[J].Journal of Northeast Agricultural University,2007,38(1):27-34. |
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| Authors: | FENG Guojun XU Qijiang LI Yuhua LIU Dajun |
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| Institution: | 1. Harbin Academy of Agricultural Sciences, Harbin 150070, China; 2. Colllege of Life Sciences, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China |
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| Abstract: | Simple sequence repeat (SSR) is an important technique of molecular markers for main agronom-ical traits and marker-assistant breeding in crop breeding. Six cultivars of Zihua, Bayuelu, Jiangjun, 73-8, 96-9, and 9z622 were used to extract high-quality genomic DNA by using the improved SDS method. In order to establish the optimized SSR detection system, the concentrations of DNA, Mg~(2+), Taq DNA polymerase, dNTPs, and the annealing temperature were optimized for SSR-PCR reaction. The optimal conditions were 0.8 ng·μL~(-1) DNA, 1.5 mmol·L~(-1) Mg~(2+), 0.05 μmol·(μL·min)~(-1) Taq DNA polymerase, and 0.2 mmol·L~(-1) dNTPs in a 25 μL SSR-PCR reaction mixture. |
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| Keywords: | SSR |
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