| 青篱柴转录组的高通量测序及分析 |
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| 引用本文： | 黄建敏,李菲,刘云静,张子楠,唐汉青,汤晓辛.青篱柴转录组的高通量测序及分析[J].西南农业大学学报,2018,40(4):25-34. |
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| 作者姓名： | 黄建敏 李菲 刘云静 张子楠 唐汉青 汤晓辛 |
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| 作者单位： | 贵州师范大学生命科学学院;贵州师范大学贵州省植物生理与发育调控重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31560184，31300317) |
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| 摘 要： | 青篱柴具有很好的观赏价值和药用价值,但其基因组信息相对缺乏,导致其分子生物学和基因功能的研究受到限制.为了获得和挖掘青篱柴的基因数据和功能,首次利用新一代高通量测序技术平台Illumina HiSeqTM2000对青篱柴转录组进行测序,经de novo组装后共得到66 755条单基因簇(Unigene).进一步利用7大公共数据库进行Blast同源比对,注释了50 339条Unigene.研究发现,558个基因参与了青篱柴次生代谢产物的生物合成,其中在甜菜红碱、芥子油苷、类黄酮、单菌霉素和苯丙素生物合成途径中的Unigene分别有2个、18个、44个、70个和231个,这些基因很可能参与了青篱柴药用活性物质的生物合成.SSR位点搜索发现,在18 972条Unigene中含有22 542个SSR位点.研究结果将为青篱柴功能基因的克隆、基因的表达、分子标记开发和遗传多样性研究奠定基础.同时,转录因子分析结果也为青篱柴的喀斯特环境适应性机制提供了初步线索.
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| 关 键 词： | 青篱柴 转录组 功能注释 SSR |
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