甜瓜基因组SSR位点分布规律与多态性初探 |
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引用本文: | 高兴旺,王贤磊,杨雅婷,张自强,卢浩,李冠.甜瓜基因组SSR位点分布规律与多态性初探[J].北方园艺,2014(15). |
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作者姓名: | 高兴旺 王贤磊 杨雅婷 张自强 卢浩 李冠 |
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作者单位: | 新疆大学资源与环境科学学院,新疆乌鲁木齐,830046;新疆大学生命科学与技术学院,新疆乌鲁木齐,830046 |
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基金项目: | 新疆高技术发展资助项目(201111120);国家自然科学基金资助项目(31260258) |
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摘 要: | 以3个甜瓜品种"BM7"、"伽师瓜"和"Y8"为试材,选取甜瓜基因组的3个DNA区域进行SSR位点的分布规律分析,进一步通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检验甜瓜基因组SSR位点的多态性,以期初步揭示甜瓜基因组中SSR位点的分布规律及其多态性,进而为甜瓜及其它物种开展相关研究提供参考。试验表明:甜瓜基因组中平均每1.9kb就有一个SSR位点,富含A和T的重复基序出现的频率远高于富含C和G的重复基序的频率,没有发现全部由C、G构成的重复基序;二、三、四碱基重复基序的SSR位点占绝大多数(83.3%),五、六碱基重复基序的SSR位点分布较少(16.7%)。二、三、四、五、六核苷酸重复基序SSR位点平均长度依次为21、15、14、16、20bp。设计的82对SSR引物中81对扩增出产物,多态比例最高为48.1%。试验表明,甜瓜基因组中SSR分布具有一定规律,并且可以利用SSR分子标记开展相关研究;试验同时对更好地开展SSR和ISSR分子标记的相关研究奠定了理论基础和依据。
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关 键 词: | 甜瓜 基因组 SSR 分布 多态性 |
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