| 黄瓜NBS类抗病基因类似物的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王昶童,曹刚强,梁丛敏,谢冰心,闫飞翔.黄瓜NBS类抗病基因类似物的生物信息学分析[J].北方园艺,2014(14). |
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| 作者姓名： | 王昶童 曹刚强 梁丛敏 谢冰心 闫飞翔 |
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| 作者单位： | 郑州大学生物工程系,河南郑州,450001;郑州大学生物工程系,河南郑州,450001;郑州大学生物工程系,河南郑州,450001;郑州大学生物工程系,河南郑州,450001;郑州大学生物工程系,河南郑州,450001 |
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| 基金项目： | 河南省重大科技攻关资助项目(112102110066) |
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| 摘 要： | 利用生物基因组学数据库,对黄瓜NBS类抗病基因类似物(RGA基因)进行生物信息学分析,以预测RGA基因编码产物的理化性质、结构与功能,为进一步研究黄瓜抗病调控机制提供一定的理论依据。结果表明:RGA基因编码产物为一个长度达84个氨基酸的蛋白,其理论分子量为10 964.32Da,理论等电点为PI 9.36,不存在跨膜区域,主要定位在细胞质中;进化比对表明,黄瓜的NBS类抗病基因在亲缘关系上与西瓜最近,其次是丝瓜;二级结构为α-β型,具有较为明显的3个螺旋和2个折叠;具有酰化位点、酪蛋白激酶II磷酸化位点和蛋白激酶C磷酸化位点3个功能位点;预测RGA基因编码产物主要充当辅酶角色参与生化反应的调控,介导基因表达调控,在抗逆相关的信号通路以及种子胚的发育等过程中发挥重要的生理功能。
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| 关 键 词： | 黄瓜 NBS RGA 生物信息学 |
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