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| 牛乳蛋白的遗传密码子使用频率分析 | |
| 引用本文： | 刘晶,于浩,杨润军,鲍永华,李俊雅,戴蕴平,赵志辉.牛乳蛋白的遗传密码子使用频率分析[J].中国兽医学报,2011,31(2). |
| 作者姓名： | 刘晶 于浩 杨润军 鲍永华 李俊雅 戴蕴平 赵志辉 |
| 作者单位： | 1. 吉林大学,畜牧兽医学院,吉林,长春,130062 2. 中国农业大学,生物学院,北京,100094 3. 中国农业科学院,北京畜牧兽医研究所,北京,100094 |
| 基金项目： | 转基因生物新品种培育重大专项资助(2008ZX08007-001,2009ZX08009-156B,2009ZX08007-005B) |
| 摘 要： | 研究牛乳蛋白不同氨基酸的密码子使用频率对利用乳腺生物反应器表达目标蛋白过程中密码子的优化具有重要意义。本试验运用ENBOSS的CHIPS和SMS中的密码子使用工具对7种牛乳蛋白编码的基因进行了分析,并将这7个编码序列拼接在一起进行了乳蛋白全基因组的密码子偏爱性研究,同时与绵羊、猪及小鼠的乳蛋白密码子偏爱性进行了比较。结果表明:牛乳蛋白的CHIPS分析Nc值为51.867,αs1-CN、αs2-CN、-βCN、-κCN、α-LB、-βLG、LTF的Nc值分别为52.005、49.967、48.746、58.113、55.514、36.274、47.646,编码牛乳蛋白氨基酸的密码子出现频率较均一;牛乳蛋白V、A、R、I、T、L、Q、P等氨基酸的密码子使用频率与其他物种有较大差异。牛乳蛋白的密码子偏爱性与绵羊最为接近。 |
| 关 键 词： | 牛乳蛋白 密码子使用频率 蛋白编码序列的密码子异质性 密码子偏爱性 |
Analysis on codon usage frequency in bovine milk protein |
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| LIU Jiang,YU Hao,YANG Run-jun,BAO Yong-hua,LI Jun-ya,DAI Yun-ping,ZHAO Zhi-hui.Analysis on codon usage frequency in bovine milk protein[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2011,31(2). | |
| Authors: | LIU Jiang YU Hao YANG Run-jun BAO Yong-hua LI Jun-ya DAI Yun-ping ZHAO Zhi-hui |
| Institution: | LIU Jiang1,YU Hao1,YANG Run-jun1,BAO Yong-hua2,LI Jun-ya3,DAI Yun-ping2,ZHAO Zhi-hui1(1.College of Animal Science and Veterinary Medicine,Jilin University,Changchun 130062,China,2.College of Biology,China Agricultural University,Beijing 100094,3.Institute of Animal Science and Veterinary Medicine,China Academy of Agriculture,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | bovine milk protein codon usage frequency CHIPS codon preference |
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