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副猪嗜血杆菌S-核糖基高半胱氨酸酶基因序列分析与推导蛋白三维结构的分子模拟
引用本文:马艳平,张杰,陈豪泰,马丽娜,赵娜,丁耀忠,刘文倩,王猛,刘永生.副猪嗜血杆菌S-核糖基高半胱氨酸酶基因序列分析与推导蛋白三维结构的分子模拟[J].中国兽医学报,2011,31(1).
作者姓名:马艳平  张杰  陈豪泰  马丽娜  赵娜  丁耀忠  刘文倩  王猛  刘永生
作者单位:1. 中国农业科学院,兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部畜禽病毒学重点开放实验室,农业部兽医公共卫生重点开放实验室,甘肃,兰州,730046;广东省农业科学院,兽医研究所,广东省兽医公共卫生公共实验室,广东广州,510640
2. 中国农业科学院,兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部畜禽病毒学重点开放实验室,农业部兽医公共卫生重点开放实验室,甘肃,兰州,730046
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30700597)
摘    要:利用PCR方法获得副猪嗜血杆菌S-核糖基高半胱氨酸酶(luxS)基因全长DNA,将PCR纯化产物与pMD18-T载体连接并转化E.coil DH5α菌株,重组阳性质粒测序并采用生物信息学软件对所推导的氨基酸序列进行三维结构分析。结果表明,该基因全长510bp,并与GenBank中登录的其他5株菌株luxS基因完整参考序列进行比较,同源性均在70%以上。用ExPAsy软件包预测了推导蛋白的特性,运用Swiss-PDB viewer软件的SWISS-Model处理器,并利用同源建模的思想建立HPS-luxS的三维结构。拉马钱德兰图证明,构建的luxS蛋白的空间结构是合理的。

关 键 词:副猪嗜血杆菌  S-核糖基高半胱氨酸酶  序列分析  分子模拟  

Sequence analysis of luxS gene of Haemophilus parasuis and homology modeling of 3D structure of the deduced protein
MA Yan-ping,ZHANG Jie,CHEN Hao-tai,MA Li-na,ZHAO Na,DING Yao-zhong,LIU Wen-qian,WANG Meng,LIU Yong-sheng.Sequence analysis of luxS gene of Haemophilus parasuis and homology modeling of 3D structure of the deduced protein[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2011,31(1).
Authors:MA Yan-ping  ZHANG Jie  CHEN Hao-tai  MA Li-na  ZHAO Na  DING Yao-zhong  LIU Wen-qian  WANG Meng  LIU Yong-sheng
Institution:MA Yan-ping1,2,ZHANG Jie1,CHEN Hao-tai1,MA Li-na1,ZHAO Na1,DING Yao-zhong1,LIU Wen-qian1,WANG Meng1,LIU Yong-sheng1(1.State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology,Key Laboratory of Animal Virology of Ministry of Agriculture,Key Laboratory of Veterinary Public Health of Ministry of Agriculture,Lanzhou Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730046,China,2.Guangdong Public Laboratory of Veterinary Public Health,Institute of Veterinary Medicine,Guangdong Academy...
Abstract:
Keywords:Haemophilus parasuis  luxS  sequence analysis  homology modeling  
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