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甘蓝BoPINs家族基因的特征和表达分析
引用本文:王玉奎,张贺翠,白晓璟,廉小平,施松梅,刘倩莹,左同鸿,朱利泉.甘蓝BoPINs家族基因的特征和表达分析[J].作物学报,2019,45(8):1270-1278.
作者姓名:王玉奎  张贺翠  白晓璟  廉小平  施松梅  刘倩莹  左同鸿  朱利泉
作者单位:西南大学农学与生物科技学院;西南大学园艺园林学院
基金项目:This study was supported by the National Natural Science Foundation of China(31572127);the Basic Research Fund of the Central University(XDJK2017C023)
摘    要:为了探索植物生长素极性运输载体蛋白编码基因BoPINs家族参与甘蓝自交不亲和性的成员数目与参与方式,本文通过转录组分析获得BoPINs家族在甘蓝自花和异花授粉后的表达情况,利用分子生物学技术和生物信息学方法对该家族的基因结构、蛋白进化亲缘关系和表达模式等特征进行分析。结果表明,甘蓝BoPINs基因家族包含8个成员,含有5~9个外显子和4~8个内含子;其编码的蛋白质的氨基酸残基数在350~650之间,相对分子质量为38~70kD;除了BoPIN5和BoPIN8不含中间亲水区以外,其余6个BoPINs家族成员都含有位于两端的疏水区和中间亲水环,它们可能以膜锚定蛋白的形式发挥作用;甘蓝BoPINs与芜菁BrPINs、拟南芥AtPINs基因家族亲缘关系较近;染色体定位分析表明,BoPIN1-1、BoPIN3-1、BoPIN3-2和BoPIN6与S位点之间发生不同程度的连锁;启动子活性分析表明,BoPINs家族蛋白参与甘蓝SI反应,可能受IAA、ABA等激素相互交叉影响;BoPIN1-1、BoPIN1-2、BoPIN2、BoPIN3-1、BoPIN3-2、BoPIN4、BoPIN6、BoPIN7-1和BoPIN7-2在柱头中表达量均较高;数据表达谱和荧光定量分析表明,8个家族成员中的6个BoPINs基因在自花授粉后下调表达;自花授粉后柱头生长素含量降低,与SI反应呈负相关。因此,在甘蓝BoPINs家族的8个成员中有6个BoPINs基因家族成员可能在膜上以负调节方式调控自交不亲和反应。

关 键 词:甘蓝  生长素  自花授粉  BoPINs  家族  自交不亲和
收稿时间:2018-10-15

Characteristics and expression analysis of BoPINs family genes in Brassica oleracea
WANG Yu-Kui,ZHANG He-Cui,BAI Xiao-Jing,LIAN Xiao-Ping,SHI Song-Mei,LIU Qian-Ying,ZUO Tong-Hong,ZHU Li-Quan.Characteristics and expression analysis of BoPINs family genes in Brassica oleracea[J].Acta Agronomica Sinica,2019,45(8):1270-1278.
Authors:WANG Yu-Kui  ZHANG He-Cui  BAI Xiao-Jing  LIAN Xiao-Ping  SHI Song-Mei  LIU Qian-Ying  ZUO Tong-Hong  ZHU Li-Quan
Institution:1.College of Agriculture and Biotechnology, Southwest University, Chongqing 400715, China;2.College of Horticulture and Gardening, Southwest University, Chongqing 400100, China
Abstract:
Keywords:Brassica oleracea  auxin  self-pollination  BoPINs family  self-incompatibility  
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