| 中国对虾SRAP分子标记体系正交优化及在遗传多样性分析中的应用 |
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| 引用本文： | 陈华增,李健,何玉英,李吉涛,王清印. 中国对虾SRAP分子标记体系正交优化及在遗传多样性分析中的应用[J]. 渔业科学进展, 2010, 31(6): 43-53 |
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| 作者姓名： | 陈华增 李健 何玉英 李吉涛 王清印 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学水产与生命学院,201306;中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划专题,国家自然科学基金课题,公益性行业专项,国家虾产业技术体系 |
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| 摘 要： | 利用正交设计L16(45)对影响中国对虾SRAP分子标记分析的5个因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP和引物浓度)在4个水平上进行了优化,筛选出各反应因素的最佳水平为:20μl反应体系中包含1.0UTaq酶,2.0mmol/L的Mg2+,40.0ng的模板DNA,0.125mmol/L的dNTP以及0.4μmol/L的引物,退火温度为53.5℃。研究表明,各因素的不同水平对扩增结果有显著影响,其中Mg2+影响最大,影响大小顺序依次为Mg2+,Taq酶,引物,dNTP和模板DNA。利用优化的SRAP分子标记体系对中国对虾黄海1号第12世代选育群体进行了遗传多样性分析,实验结果表明,此标记技术可作为中国对虾遗传分析的良好技术工具。遗传多样性分析共筛选出8对可以扩增出清晰稳定条带的引物组合,共获得171个位点,其中多态性位点154个,占90.08%;有效等位基因数为1.7741,期望杂合度均值为0.4219,Shannon多样性指数为0.6055。上述参数值均高于应用AFLP技术对前几代选育群体的遗传多样性分析结果。
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| 关 键 词： | 中国对虾 正交设计 SRAP 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2009-12-13 |
| 修稿时间： | 2010-04-13 |
Optimization of SRAP-PCR System Using Orthogonal Design and its Application to Genetic Analysis in Fenneropenaeus chinensis |
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| CHEN Hua-zeng,LI Jian,HE Yu-ying,LI Ji-tao,WANG Qing-yin. Optimization of SRAP-PCR System Using Orthogonal Design and its Application to Genetic Analysis in Fenneropenaeus chinensis[J]. Progress in Fishery Sciences, 2010, 31(6): 43-53 |
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| Authors: | CHEN Hua-zeng LI Jian HE Yu-ying LI Ji-tao WANG Qing-yin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Fenneropenaeus chinensis Orthogonal design SRAP Genetic diversity |
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