| 母猪VEGF基因mRNA全序列的克隆与分析 |
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| 引用本文： | 陈来华,王立贤,王立刚,季跃光,颜华,张龙超. 母猪VEGF基因mRNA全序列的克隆与分析[J]. 中国畜牧兽医, 2008, 35(6) |
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| 作者姓名： | 陈来华 王立贤 王立刚 季跃光 颜华 张龙超 |
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| 作者单位： | 1. 新疆农业大学动物科技学院,乌鲁木齐,830052;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京,100193
2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京,100193 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划 ， 国家高技术研究发展计划(863计划) |
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| 摘 要： | 本研究运用多种分子生物学方法对母猪胎盘VEGF mRNA全序列进行克隆和分析,结果发现:母猪胎盘VEGFmRNA全长约3500 bp,其完整的cDNA编码190个氨基酸,通过同源性比较预测了VEGF基因的DNA序列全长约为16kb。VEGF基因编码的氨基酸序列与人、小鼠和恒河猴的同源性分别为78.82%、79.44%和96.34%。经生物信息学分析,预测VEGF蛋白理论分子量为22.33 kD,其等电点为7.89;大约在1~20,40~45,50~60,65~80,100~105位之间的氨基酸存在疏水性区域,用TMHMM2.0分析猪VEGF的跨膜结构发现此蛋白所有氨基酸都位于膜表面,证实了VEGF是一种表面蛋白。用signalP 3.0分析发现在1~27位氨基酸可能为信号肽(P=0.999),且可能在26和27位氨基酸之间发生切割(P=0.956)。对VEGF核苷酸序列和氨基酸序列、蛋白质结构和功能的分析,进一步证实本研究得到了VEGF基因mRNA的全序列,为VEGF基因与母猪繁殖性能的关联性研究提供依据。
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| 关 键 词： | 猪 VEGF基因 全序列克隆 生物信息学分析 |
Complete VEGF mRNA Cloning and Bioinformarics Analysis in Porcine |
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| CHEN Lai-hua,WANG Li-xian,WANG Li-gang,JI Yue-guang,YAN Hua,ZHANG Long-chao. Complete VEGF mRNA Cloning and Bioinformarics Analysis in Porcine[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2008, 35(6) |
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| Authors: | CHEN Lai-hua WANG Li-xian WANG Li-gang JI Yue-guang YAN Hua ZHANG Long-chao |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | porcine VEGF gene complete VEGF cloning bioinformatics analysis |
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