| 水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族同义密码子使用偏好的比较 |
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| 引用本文： | 张晓峰,薛庆中.水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族同义密码子使用偏好的比较[J].作物学报,2005,31(5):596-602. |
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| 作者姓名： | 张晓峰 薛庆中 |
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| 作者单位： | 浙江大学农业与生物技术学院农学系，浙江杭州310029 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，浙江省科研项目，浙江省水产种子种苗工程建设项目 |
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| 摘 要： | 应用软件CodonW，对全基因组进行分析，鉴定出水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族的最优密码子分别为25和16种。NBS-LRR基因家族与其全基因组的最优密码子一致，但两个物种间彼此完全不一致，密码子使用上发生偏向的程度也不尽相同。说明NBS-LRR基因家族的密码子使用偏好受物种自身的影响很大。同时，同一物种内基因家族对密码子的
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| 关 键 词： | 水稻 拟南芥 NBS-LRR基因 密码子用法 |
| 收稿时间： | 2004-04-01 |
| 修稿时间： | 2004年4月1日 |
Synonymous Codon Bias of NBS-LRR Gene Family in Rice and Arabidopsis |
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| ZHANG Xiao-Feng,XUE Qing-Zhong.Synonymous Codon Bias of NBS-LRR Gene Family in Rice and Arabidopsis[J].Acta Agronomica Sinica,2005,31(5):596-602. |
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| Authors: | ZHANG Xiao-Feng XUE Qing-Zhong |
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| Institution: | Department of Agronomy, College of Agriculture and Biotechnology, Zhejiang University, Hangzhou 310029, Zhejiang |
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| Abstract: | The variation in codon usage of NBS-LRR gene in completely sequenced genomes of rice and Arabidopsis families both within and between genomes was investigated using a universal multivariate analysis program--CodonW. In 59 synonymous codons detected, 25 optimal codons of rice and 16 optimal codons of |
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| Keywords: | Rice Arabidopsis NBS-LRR gene Codon usage |
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