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斑点叉尾鮰趋化因子SCYA126基因及其可变剪接
引用本文:鲍宝龙,李家乐,汪桂玲,刘占江. 斑点叉尾鮰趋化因子SCYA126基因及其可变剪接[J]. 中国水产科学, 2007, 14(1): 1-7
作者姓名:鲍宝龙  李家乐  汪桂玲  刘占江
作者单位:1. 上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海,200090
2. 上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海,200090;奥本大学,水产养殖系,阿拉巴马州,36849,美国
基金项目:上海市教委资助项目;上海市科委资助项目;上海市高校水产养殖E-研究支持项目
摘    要:通过探针杂交筛选斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)BAC基因组文库,利用引物步移的方法对阳性克隆BAC047_K12进行序列测定,得到2815bp的SCYA126基因组序列。序列分析表明,SCYA126基因由2个外显子和1个内含子组成;外显子拼接的序列与SCYA126 cDNA序列完全一致,编码92个氨基酸,在N端含有2个相邻的半胱氨酸(CC)和2个不相邻的半胱氨酸,为典型的CC趋化因子亚家族成员;其上游调控序列包含TATA框启动子序列和一些与免疫相关的转录因子结合位点。另外,根据与GenBank接收号为BM029630的EST序列的比较分析,发现SCYA126基因组中的内含子没有被剪接,导致翻译后可能产生N端部分缺失的SCYA126蛋白。在胰脏和肝脏中确认了高表达的包含内含子的mRNA的存在,而且其表达量要明显高于正常剪接的SCYA126mRNA。

关 键 词:斑点叉尾鮰  趋化因子  RNA可变剪接
文章编号:1005-8737-(2007)01-0001-07
收稿时间:2006-02-13
修稿时间:2006-06-20

Characterization of chemokine gene SCYA126 and its alternative splicing in channel catfish ( Ictalurus punctatus )
BAO Bao-long,LI Jia-le,WANG Gui-ling,LIU Zhan-jiang. Characterization of chemokine gene SCYA126 and its alternative splicing in channel catfish ( Ictalurus punctatus )[J]. Journal of Fishery Sciences of China, 2007, 14(1): 1-7
Authors:BAO Bao-long  LI Jia-le  WANG Gui-ling  LIU Zhan-jiang
Affiliation:1.The Key Laboratory Aquatic Genetic Resources and Aquaculture Ecology (AGRA
Abstract:
Keywords:SCYA126
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