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巴西橡胶树HbRD22基因的电子克隆与生物信息学分析
引用本文:高静,程汉,蔡海滨,安泽伟,黄华孙.巴西橡胶树HbRD22基因的电子克隆与生物信息学分析[J].热带作物学报,2010,31(9):1439-1445.
作者姓名:高静  程汉  蔡海滨  安泽伟  黄华孙
作者单位:中国热带农业科学院科技信息研究所;中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心;中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心;中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心;中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心
基金项目:国家天然橡胶产业技术体系;中国热带农业科学院橡胶研究所基本业务费项目
摘    要:利用电子克隆技术从低温诱导的巴西橡胶树全长cDNA文库中获得了HbRD22基因,该基因全长1 458 bp。生物信息学分析结果表明,HbRD22编码一个由338个氨基酸组成的、相对分子量为36.96 ku、等电点为7.65的多肽,并含有一个由217个氨基酸组成的BURP结构域。其推导的氨基酸序列与葡萄的同源性最高,达69%。信号肽预测结果表明HbRD22蛋白为分泌型蛋白,前21个氨基酸区域为信号肽区域。Northern blotting分析结果表明,该基因在正常生长情况下,表达水平较高,干旱胁迫后24 h,表达量逐渐减低,直至检测不到,揭示该基因受干旱胁迫负调控。

关 键 词:巴西橡胶树  HbRD22基因  电子克隆  生物信息学

In silico Cloning and Bioinformatics Analysis of HbRD22 Gene from Hevea brasiliensis
Gao Jing,Cheng Han,Cai Haibin,An zewei and Huang huasun.In silico Cloning and Bioinformatics Analysis of HbRD22 Gene from Hevea brasiliensis[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2010,31(9):1439-1445.
Authors:Gao Jing  Cheng Han  Cai Haibin  An zewei and Huang huasun
Institution:Rubber Research Institute/State Breeding Center for Rubber Tree, CATAS;Institute of Scientific and Technical information, CATAS;Institute of Scientific and Technical information, CATAS;Institute of Scientific and Technical information, CATAS;Institute of Scientific and Technical information, CATAS
Abstract:
Keywords:
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