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马铃薯microRNA及其靶基因的预测与功能分析
引用本文:李世风,张宁,刘柏林,杜宏辉,司怀军,王蒂. 马铃薯microRNA及其靶基因的预测与功能分析[J]. 甘肃农业大学学报, 2010, 45(6)
作者姓名:李世风  张宁  刘柏林  杜宏辉  司怀军  王蒂
基金项目:国家自然科学基金,国家"863"项目
摘    要:根据miRNA序列在植物中的高度保守性,通过拟南芥、水稻、玉米等植物中已知的miRNA序列与马铃薯的表达序列标签(EST)、基因组测序序列(GSS)以及核酸数据库中的序列进行比对,最后通过在线比对软件blastx去掉编码序列,共发现32条新的miRNAs,并且这32条前体均可折叠形成miRNA家族的标准二级结构;利用新发现的马铃薯miRNAs通过在线软件miRU和miRU2与编码蛋白的数据库比对,预测到了100个靶基因,分别编码与马铃薯生长发育、新陈代谢、信号转导、转录调节、胁迫反应等相关的蛋白.

关 键 词:马铃薯  microRNA  靶基因  功能

Prediction and function analysis of microRNA and target genes in potato
LI Shi-feng,ZHANG Ning,LIU Bo-lin,DU Hong-hui,SI Huai-jun,WANG Di. Prediction and function analysis of microRNA and target genes in potato[J]. Journal of Gansu Agricultural University, 2010, 45(6)
Authors:LI Shi-feng  ZHANG Ning  LIU Bo-lin  DU Hong-hui  SI Huai-jun  WANG Di
Abstract:
Keywords:potato   microRNA   target gene   function
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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