| 三疣梭子蟹微卫星文库的构建及序列分析 |
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| 引用本文： | 刘汝,许强华.三疣梭子蟹微卫星文库的构建及序列分析[J].上海海洋大学学报,2010(6):728-733. |
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| 作者姓名： | 刘汝 许强华 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室, 上海 201306;上海海洋大学大洋生物资源开发与利用上海市高校重点实验室, 上海 201306;上海海洋大学海洋科学学院, 上海 201306 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30800840); 上海市科委青年科技启明星人才计划项目(09QA1402600) |
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| 摘 要： | 采用磁珠富集法筛选三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)的微卫星序列。经Sau3AI酶切后的200~1000bp DNA纯化片段,与两端已知序列的人工接头连接,用含有生物素标记的(CA)12和(GA)12探针杂交,根据磁珠的链酶亲和素与生物素特异结合的特性,捕获含微卫星序列的单链DNA,以此为模板用人工接头序列为引物进行PCR扩增,随后将获得的片段连接到PMD18-T载体上,转化至DH5α感受态细胞中,成功构建了微卫星富集文库。测序其中的60个阳性克隆,得到42条微卫星序列(基因登录号为:HQ283153-HQ283194),除探针使用的CA/GT、GA/CT重复外,还得到GAGT重复序列。42条微卫星序列中,完美型31个(占73.8%),非完美型9个(占21.4%),混合型2个(占4.8%)。完美型的比例显著高于非完美型,这与其他真核生物微卫星序列的特征相一致。39条微卫星序列的重复次数大于10(占92.9%),其中,重复次数在10~19次之间的有27个,20次以上的有12个。筛选出的微卫星位点可为今后三疣梭子蟹遗传多样性评价、种群遗传结构鉴定及资源保护研究提供一套有用的分子标记。
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| 关 键 词： | 三疣梭子蟹 磁珠富集法 筛选 微卫星 多态性 |
| 收稿时间： | 2010/7/14 0:00:00 |
Construction of microsatellite library and sequences analysis of the swimming crab (Portunus trituberculatus) |
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| LIU Ru,XU Qiang-hua.Construction of microsatellite library and sequences analysis of the swimming crab (Portunus trituberculatus)[J].Journal of Shanghai Ocean University,2010(6):728-733. |
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| Authors: | LIU Ru XU Qiang-hua |
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| Institution: | The Key Laboratory of Shanghai Education Commission for Oceanic Fisheries Resources Exploitation, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China;The Key Laboratory of Sustainable Exploitation of Oceanic Fisheries Resources, Ministry of Education, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China;College of Marine Sciences, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Portunus trituberculatus enrichment by magnetic beads screening microsatellite polymorphism |
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