西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH基因的遗传进化、分子特征和抗原性分析 |
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引用本文: | 李义兴,孟朝轶,符汉宇,王运路,刘博华,徐业芬,包玉花,牛家强,索朗斯珠.西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH基因的遗传进化、分子特征和抗原性分析[J].高原农业,2023(1):40-49. |
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作者姓名: | 李义兴 孟朝轶 符汉宇 王运路 刘博华 徐业芬 包玉花 牛家强 索朗斯珠 |
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作者单位: | 1. 西藏农牧学院动物科学学院;2. 西藏农牧学院西藏高原动物疫病研究自治区高校重点实验室;3. 西藏自治区兽医生物药品制造厂 |
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基金项目: | 国家肉牛牦牛产业体系项目(CARS-37); |
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摘 要: | 本研究旨在分析一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH基因的遗传进化、分子特征和抗原性。从一株西藏牦牛源B型多杀性巴氏杆菌的全基因组测序中获得OmpH基因序列,对其核苷酸序列进行遗传进化分析,通过生物信息学软件在线对OmpH基因编码的氨基酸序列进行理论分子质量、理论等电点、亲水性和疏水性、跨膜结构、结构域、二、三级结构及抗原性分析。结果表明OmpH基因全长1 002 bp,编码333个氨基酸;遗传进化分析发现,西藏牦牛源Pm的OmpH基因与新疆牦牛源的同源性最近。OmpH蛋白的分子特性分析发现该蛋白为亲水性蛋白,较为稳定,具有信号肽结构,所有序列均在膜外,无跨膜结构,属于分泌型蛋白,在PFAM数据库中存在Porin_1结构域及低复杂性区域;该蛋白的二、三级蛋白结构分析发现分子同源三聚体构成,其中无规则卷曲占比45.35%,结构较为稳定。抗原性分析OmpH蛋白的保护性抗原的总体预测为0.6945,高出正常阈值0.2945。OmpH具有抗原性的可能性较大,可作为免疫原性蛋白和多杀性巴氏杆菌疫苗的较佳候选抗原。
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关 键 词: | 牦牛 多杀性巴氏杆菌 OmpH基因 遗传进化 分子特征 抗原性 |
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