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不同时期NDV地方株F基因的克隆及序列分析与基因型研究
引用本文:程相朝,李祥瑞,吴志明,李银聚,吴庭才,张春杰. 不同时期NDV地方株F基因的克隆及序列分析与基因型研究[J]. 中国兽医学报, 2006, 26(5): 491-495
作者姓名:程相朝  李祥瑞  吴志明  李银聚  吴庭才  张春杰
作者单位:1. 河南科技大学,动物科技学院,河南,洛阳,471003
2. 南京农业大学,动物医学院,江苏,南京,210095
3. 河南省兽医防治站,河南,郑州,450002
基金项目:河南省高校青年骨干教师资助项目
摘    要:利用RT-PCR技术对1998-2002年闯洛阳地区新城疫典型发病禽群中所分离到的15个毒株的F基因主要功能区片段进行了克隆和序列分析,并根据其47~435位核苷酸序列构建了系统进化树,确定了其毒力强弱和基因型。结果显示,依据核苷酸和推导的氨基酸同源性的不同,15个地方毒株可分为3群,群内各毒株同源性较高,群间差异较大,未发现有因分离禽品种不同所引起的明显的株间差异。其中第1群9株,涉及到各时间段分离的毒株和所有分离禽品种,属典型的基因Ⅶ型强毒株,高度集中于进化树的基因Ⅶ型C亚型区;第2群4株,属传统的基因Ⅵ型强毒株。分散于进化树的基因Ⅵ型区;第3群2株,属古典基因Ⅱ型的弱毒株,分散于进化树的基因Ⅱ型区。结果表明,近年来该地区流行的新城疫病毒以新的基因Ⅶ型为主,同时兼有传统的基因Ⅵ型和古老的基因Ⅱ型;并提示基因Ⅶ型各毒株在该地区流行的时间较短,株间差异不大。

关 键 词:鸡新城疫病毒  F基因  序列分析  进化树  基因型
文章编号:1005-4545(2006)05-0491-04
收稿时间:2004-12-02
修稿时间:2004-12-02

Genetic Variation and Genotype of Newcastle Disease Virus Isolates in Luoyang Area of Henan Province
CHENG Xiang-chao,LI Xiang-rui,WU Zhi-ming,LI Yin-ju,WU Ting-cai,ZHANG Chun-jie. Genetic Variation and Genotype of Newcastle Disease Virus Isolates in Luoyang Area of Henan Province[J]. Chinese Journal of Veterinary Science, 2006, 26(5): 491-495
Authors:CHENG Xiang-chao  LI Xiang-rui  WU Zhi-ming  LI Yin-ju  WU Ting-cai  ZHANG Chun-jie
Affiliation:1. College of Animal Science and Technology,Henan University of Science and Technology,Luoyang, Henan 471003,China;2. College of Veterinary Medicine ,Nanjing Agriculture University ,Nanjing 210095 ,China ; 3. Henan Veterinary Prevention and Control Station ,Zhengzhou 450002 ,China
Abstract:
Keywords:Newcastle disease virus    fusion gene    sequence analysis    phylogenetic tree   genotype
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